Micro DNA-BS pico-DNA基因组甲基化测序

单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库测序技术。传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。易基因建立了基于线性扩增和单管建库的技术，可充分降低文库偏好性，准确的完成珍贵样本的全基因组甲基化研究。

单细胞及微量样本的甲基化研究主要应用于肿瘤发生机制，癌症研究，胚胎植入前诊断，胚胎早期发育，生殖细胞重组，干细胞及细胞异质性等研究领域。应用的样本包括单细胞、微量细胞等。

技术优势：

Ø  超低起始量：仅需大于5ng的DNA或微量的细胞；

Ø  样本种类繁多：细胞、FFPE、cfDNA；

Ø  单碱基分辨率：可精确分析每一个C碱基的甲基化状态。

实验策略：

分析内容：

注：个性化分析、多组学关联分析请联系对接销售或技术支持

送样要求：

经典案例

微量细胞样本Micro DNA-BS绘制猴子植入前胚胎发育中的DNA甲基化图谱

Gao F, et al. De novo DNA methylation during monkey pre-implantation embryogenesis. Cell Res. 2017 Apr;27(4):526-539. pii: cr201725.

1、背景

可能由于技术上的限制，还没有研究揭示早期胚胎发育过程中的全基因组DNA再甲基化。

2、方法

利用具有超低DNA起始量（100个细胞）的微量细胞全基因组DNA甲基化测序技术（Micro DNA-BS）绘制灵长类动物（恒河猴，Macaca mulatta）植入前胚胎发育的全基因组甲基化图谱。

3、结论

本研究使用Micro DNA-BS对猴子早期胚胎发育过程的5mC进行单碱基分辨率、高覆盖率的甲基化分析。分析结果鉴定了发育过程中的全基因组DNA去甲基化和从头甲基化，特别是在从2细胞到8细胞阶段的过渡期间，研究全面阐明了DNA甲基化动力学的“兴衰”。此外，DNA甲基转移酶敲降实验表明，异常的DNA甲基化会影响灵长类动物早期胚胎的正常发育。本研究结果进一步完善了目前关于哺乳动物DNA甲基化重编程的知识体系，并为未来灵长类动物胚胎发育的研究提供了宝贵的数据资源。

成对比较揭示植入前胚胎发育过程中全基因组DNA去甲基化和从头甲基化

参考文献：

①     DOI:10.1038/cr.2017.25