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中科院大连化物所团队提出第三代代谢组学技术框架

2026年10月16日 10:58:40 来源:化工仪器网 作者:宋池 点击量:239

中科院大连化物所团队系统总结了质谱代谢组学技术进展及关键挑战,提出以“规范化、流程化、自动化和智能化”为核心的第三代代谢组学技术框架,并展望“黑灯实验室”和“以代谢组为中心的数字孪生”发展方向。

  近日,中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)刘心昱研究员和许国旺研究员团队,在前期工作基础上,系统总结了质谱代谢组学技术进展及关键挑战,提出了第三代代谢组学技术框架,并展望了“黑灯实验室”和“以代谢组为中心的数字孪生”的发展方向,为代谢组学技术创新及精准医学应用提供了新思路。
 
  基于质谱的代谢组学主要包括非靶向和靶向两种策略。为兼顾两者优势,团队于2012年提出拟靶向代谢组学策略(J. Chromatogr. A,2012),即通过非靶向分析获取代谢物离子对信息,再采用靶向MRM模式进行样品分析,兼顾检测覆盖度与定量稳定性。该策略被代谢组学知名学者Oliver Fiehn教授称为“第二代代谢组学”。团队围绕离子对自动选择、大规模数据校正等方面开展了系列研究,并形成标准化方法范本(Nat. Protoc.,2020)。相关方法已应用于疾病、药物、食品、农业及环境科学等多个领域。
 
  随着代谢组学研究向高通量、大规模和多中心方向发展,分析结果的重复性与可比性、代谢物结构注释及数据挖掘能力等问题日益突出。尽管人工智能已应用于代谢组学多个环节,但仍较为分散,缺乏系统性整合。针对上述问题,研究团队系统总结了人工智能在代谢组学各环节的研究进展,提出了以“规范化、流程化、自动化和智能化”为核心的第三代代谢组学发展框架。
 
  其中,规范化贯穿样品采集、分析及数据处理;流程化促进各分析环节有序衔接;自动化减少样品前处理与仪器分析中的人工操作误差和劳动强度;智能化则加强知识挖掘与应用。不同于现有针对单一环节的技术优化,第三代代谢组学强调上述四个方面的有机融合,并引入AI智能体协调实验设计、仪器控制、数据处理及结果解析等环节,实现基于数据反馈的过程优化与智能决策,逐步构建全流程闭环分析体系。该研究为代谢组学技术创新及精准医学应用提供了新思路。
 
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