化工仪器网手机版
移动端访问更便捷
新方法可识别污水中更多可转移的耐药基因载体
2026年10月12日 13:56:01
来源：化工仪器网 作者：宋池 点击量：667
南方科技大学夏雨团队与合作者在《自然—水》发表研究，将滤膜接合与纳米孔选择性测序结合，无需单独提取质粒DNA，即可从污水处理系统中回收更多能在细菌间转移、可能携带耐药基因的质粒，为追踪耐药基因传播提供了新方法。
近日，南方科技大学副教授夏雨团队与合作者在《自然—水》发表研究，提出将滤膜接合法与纳米孔选择性测序技术结合，建立滤膜接合与纳米孔选择性测序联用流程（FM-NSS）。研究显示，该流程无需单独提取质粒DNA，即可在总DNA中直接富集污水处理系统中的可接合耐药质粒，扩展了可捕获接合质粒的识别范围。
污水处理厂汇集来源多样的微生物，是耐药基因交换的热点场所。接合质粒能够携带耐药基因在细菌间转移，解析其组成与分布，是理解污水处理过程中耐药基因传播的重要基础。但研究指出，常规质粒提取易因提取偏差和试剂盒偏好产生偏倚，低丰度质粒也常被海量染色体序列淹没，部分具有转移潜力的质粒难以被充分捕获识别。
为此，研究团队将滤膜接合的定向捕获能力与纳米孔选择性测序的实时读段筛选能力结合。他们以荧光标记的大肠杆菌作为受体，通过滤膜接合法捕获污水菌群中真实发生转移的接合质粒，再利用纳米孔选择性测序实时弹出受体细胞基因组读段，从而在总DNA中直接富集目标质粒。研究将该流程应用于深圳一座市政污水处理厂的进水、厌氧污泥、缺氧污泥和活性污泥样本，并结合质粒分型与抗性基因注释开展分析。
论文摘要称，研究聚焦于经氨苄青霉素筛选、与受体兼容的接合质粒组分。在去除与大肠杆菌受体基因组比对上的读段后，FM-NSS共获得约110万条质粒测序读段。从头组装得到622条非冗余质粒序列，平均长度为24.21 kb，最长达到202.80千碱基对(kb)。其中，441条序列未被同一接合子池的常规质粒提取测序流程检出，在覆盖原有可检出序列的基础上进一步扩展了回收范围。
进一步分析显示，不同处理阶段的可捕获质粒在组成和功能上存在差异。研究识别出440条在四类样本中均检出的核心质粒序列，以及32条仅在活性污泥中检出的序列。活性污泥中的独特质粒谱与较高的预测微生物生长潜力相伴出现。从质粒群体层面看，375个质粒可依据复制子序列归入具体不相容群；关联网络显示，MOBQ与多类抗性基因具有较广泛联系，IncP型质粒与OXA-58、TEM-176等β-内酰胺类抗性基因存在较强关联。
研究团队表示，该研究把实验可捕获性与选择性测序衔接起来，在减少染色体背景对测序资源占用、省去单独提取质粒DNA环节的同时，识别出更多常规流程容易遗漏的质粒序列，为追踪污水处理系统中的可移动耐药遗传元件提供了更丰富的序列基础。
同时，研究也指出局限性：FM-NSS所获得的是经过筛选的可捕获质粒组分，其范围受滤膜接合条件、受体兼容性及筛选条件共同影响，不等同于污水环境中的全部质粒。
相关阅读 Related Reading
查看更多+-
预算超1.04亿元！福州大学附属省立医院发布医疗设备采购意向
福州大学附属省立医院公示一批医疗设备采购意向，总预算高达10438.5万元。2026-10-12 09:30:57 -
近日，昆明理工大学就“昆明理工大学基础医学院临床医学实践实训平台建设项目仪器采购”发布公开招标公告，预算金额为598万元。2026-10-10 09:58:31
-
招标预算超1亿元！江苏省药品监督检验研究院大批实验室设备更新
此次项目建设拟采购253台/套实验室及药品检验检测设备，采购预算总金额高达10985.6万元。2026-10-09 09:55:17 -
项目名称：自动化多肽合成仪，项目编号：1447-26480753W127，招标范围：自动化多肽合成仪，招标机构：上海健生教育配置招...2026-10-08 17:37:45
-
超5000万元Pre‑A轮融资落地！追光生物深耕光电镊技术布局国产生命科学仪器
追光生物科技（深圳）有限公司近日完成超5000万元Pre-A轮融资。企业依托自主光电镊核心技术，打造单细胞操控全套仪器装备，本轮融...2026-10-08 13:56:26
版权与免责声明
- ①凡本网注明“来源：化工仪器网”的所有作品，均为浙江兴旺宝明通网络有限公司-化工仪器网合法拥有版权或有权使用的作品，未经本网授权不得转载、摘编或利用其他方式使用上述作品。已经本网授权使用作品的，应在授权范围内使用，并注明“来源：化工仪器网”。违反上述声明者，本网将追究其相关法律责任。
- ②本网转载并注明自其他来源（非化工仪器网）的作品，目的在于传递更多信息，并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责，不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时，必须保留本网注明的作品第一来源，并自负版权等法律责任。
- ③如涉及作品内容、版权等问题，请在作品发表之日起一周内与本网联系，否则视为放弃相关权利。
