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OncoCyte选择Ion Torrent助力肺癌检测方案走向临床

阅读:35      发布时间:2024-11-20
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自OncoCyte公司选择赛默飞Ion GeneStudio S5二代测序平台开发癌症早筛产品以来,近日OncoCyte公司表示可在今年年底推出非侵入性(液体活检)肺癌检测方案,并使用人口对照,盲测样本队列执行的内部验证,从而获得强大的性能数据。

DetermaVu™液体活检肺癌检测方案

OncoCyte公司的这一肺癌检测方案称为DetermaVu™,通过对一组与人体癌症免疫应答相关的基因表达生物标志物进行分析,确定偶然或筛检发现的肺部结节是否会发展成癌症

OncoCyte公司执行官Bill Annett表示,这项检测方案的应用价值在于将大大减少不必要的肺组织活检,因为肺部活检除价格高昂外,还存在较高的并发症发生率。例如,近期在JAMA Internal Medicine上发表的一项研究调研了接受肺活检的近350,000名患者的医疗记录,并得出结论:65岁以下患者的并发症发生率为22.2%,65岁及以上患者的并发症发生率为24%。

OncoCyte选择Ion Torrent二代测序平台

OncoCyte公司在获得Wistar研究所后开始将DetermaVu™商业化,最初预计于2017年底在市场上推出该产品。然而,2017年底,原先使用的基因检测平台在重现性方面面临一些挑战,从而使Oncyte公司开始寻找更合适的工具来帮助DetermaVu™走向临床。2018年,OncoCyte公司对四个平台进行了评估,最终选择了Ion Torrent二代测序平台

OncoCyte公司的研发高级副总裁Lyndal Hesterberg表示:

可以说Ion Torrent二代测序平台符合我们所有的期望,而且它确实能实现我们所需的性能。

OncoCyte在Ion Torrent平台上分析700个样本

虽然,OncoCyte公司对平台和基因特征的重新考虑导致了公司商业计划的推迟,Hesterberg仍认为这一过程是必要的,这反映了OncoCyte公司对DetermaVu™的重视,要确保将其顺利推向市场。

有趣的是,平台评估过程导致的计划延迟也为根据新基因表达阵列产品和数据重新检测生物标志物的特征提供了机会,这些产品和数据集在DetermaVu™开发初期还没有,因此,OncoCyte公司决定增加新的生物标志物,将其整合到新算法中。OncoCyte公司在本周报告验证数据之前,在Ion Torrent平台上对700个样本进行了分析,增加的生物标志物完善了其算法。

虽然平台和生物标志物发现从头开始看起来是奇怪的举措,但Hesterberg 称,公司在验证中观察到的性能优势是显而易见的。

公司使用250个独立盲测样本检测了DetermaVu™的性能,Hesterberg表示,这些样本是专门为尽可能接近地反映接受检测的实际临床人群收集的。结果表明,该DetermaVu™assay的灵敏度为90%,特异性为75%,与公司2017年所预期的数据接近,并且有更强大的性能。

 

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