建所60多年以来，在国家烟草专卖局、中国烟草总公司的长期关怀下，在省局（公司）的正确领导下，一直秉承“求实创新、拼搏奉献"的精神，以科技兴烟为己任，为贵州烟草发展与科技进步做出了积极的贡献。

贵州省烟草科学研究所的前身是国民政府农林部烟产改进处于1948年11月22日成立的“贵州烟叶改良场"。解放后，经历了贵阳—贵定—福泉—贵阳三次搬迁，多次变动隶属关系。1987年由贵州省农业厅主管划归贵州省烟草专卖局主管；1999年国家烟草专卖局以烟科所为基础挂牌成立中国烟草西南农业试验站；2006年国家烟草专卖局批复将贵州省烟草科学研究所整体划归贵州省烟草专卖局（公司），理顺了体制与关系。

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