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布鲁克 GeoMx DSP 数字空间多组学分析系统
布鲁克 GeoMx DSP 数字空间多组学分析系统以特异性解析组织异质性在组织空间背景下精准解析不同组织功能区域中不同细胞群理解组织异质性对于研究发育生物学、疾病发生发展机制以及对治疗的响应极为重要。布鲁克 GeoMx DSP 数字空间多组学分析系统弥补了组织成像和分子表达检测(如单细胞测序等)之间的鸿沟,支持您从空间多组学角度解锁新的生物学见解。
技术原理
布鲁克 GeoMx DSP 数字空间多组学分析系统采用传利技术在抗体或者RNA上偶联DNA Oligo。每个DNA Oligo对应一个靶标,最高可达96个蛋白靶标或>1000个RNA靶标(二代测序输出)。当抗体或RNA与组织上的靶标结合后,GeoMx Digital Spatial Profiler利用激光切断DNA oligo与抗体或RNA之间的连接物,从而释放出DNA Oligo以进行下一步定量。
主要特点:
1. 多靶标:可在-张FFPE组织 上定份析高达10000多种RNA或最高96种蛋白质
2. 原位:采用1-4种荧光抗体染色获取组织的形态学信息
3. 多维度:既可定分析蛋白质,也可定量分析RNA
4. 高精度:可达单细胞水平
5. 精准定量:采用数字化单分子计数技术,最高达106水平
6. 样本无损:整个操作过程对样本无损伤,利于保存珍贵样本
7. 高通量: -天可分析多达12份组织样本
弹性专注于您感兴趣的目标区域
科研者可以灵活的圈选策略,高效地理解组织结构。由于不同组织的特点,研究人员往往在单一载玻片上可能对某一区域特别感兴趣。在保留组织样本完整性的情况下,GeoMx Digital Spatial Profiler可以允许使用者在单张载玻片上根据组织轮廓选取感兴趣区域(Region Of Interest, ROI),甚至选取稀有细胞群体进行分析。
工作原理
利用标准IHC方法,将成像试剂(荧光标记的抗体或探针)、定量试剂(DNA条形码标记的抗体或探针)和组织切片进行杂交孵育。在DSP仪器中完成组织成像、感兴趣区域(ROI)圈选,接下来与感兴趣区域形状匹配的紫外光束照射该区域,使得该区域内的DSP条形码得以释放并被自动收集,进而利用高通量测序(NGS)进行表达定量,最终得到的是组织中不同空间区域的表达谱信息。
1. 样本制备:任何样本(FFPE或新鲜冷冻样本);任何形态学标记物;检测RNA和/或蛋白质。
2. 样本检测:利用GeoMx DSP对RNA和蛋白质进行自动化组织成像和分子检测。
3. 表达定量:利用NGS进行表达定量。
4. 数据分析:预置的数据处理流程,交互式数据分析界面。
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