上海一韦仪器科技有限公司
一韦仪器HGC24L立式冷冻组织研磨仪|冻存粪便肠道菌群宏基因组前处理解决方案
检测样品:冻存粪便肠道菌群宏基因组
检测项目:前处理
方案概述:本方案用一韦仪器HGC24L立式冷冻组织研磨仪在 -20 ℃ 预冷珠磨下把冻块做成均质悬液,以 α 多样性、批间 RSD、宿主 DNA 残留率三项指标守住宏基因组的前端入口。
粪便宏基因组的最大敌人不是测序,而是「取样那一下就不均」。冻存粪便里冰晶把菌群包在蜂窝状基质中,开盖回温还会让短链脂肪酸挥发、厌氧菌经历热休克,下游表现为 α 多样性被压扁、批间 RSD 失控、宿主 DNA 占比过高吃掉有效 reads。本方案用一韦仪器HGC24L立式冷冻组织研磨仪在 -20 ℃ 预冷珠磨下把冻块做成均质悬液,以 α 多样性、批间 RSD、宿主 DNA 残留率三项指标守住宏基因组的前端入口。
样品正名:健康成人志愿者冻存粪便(伦理批件号 ×××-××),-80 ℃ 保存不超过 3 个月,每例取 200 mg 冻块,不写「粪便样本」这类笼统表述。
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