PBDB-T-F, PM6、CAS号：1802013-83-7

PBDB-T-F, PM6、CAS号：1802013-83-7

中文名称：PM6

中文同义词：

9'-(2,12-DI-TERT-BUTYL-5,9-DIOXA-13B-BORANAPHTHO[3,2,1-DE]ANTHRACEN-7-YL)-9,9''CHEMICALBOOK-DIPHENYL;P9203;聚[(2,6-(4,Chemicalbook8-双(5-(2-乙基己基-3-氟)噻吩-2-基)-苯并[1,2-B:4,5-B']二噻吩])-ALT-(5,5-(1',3'-二-2-噻吩-5',7'-双(2-乙基己基)苯并[1',2'-C:4',5'-C']二噻吩-4,8-二酮)

英文名称：PM6

英文同义词：

9'-(2,12-di-tert-butyl-5,9-dioxa-13b-boranaphtho[3,2,1-de]anthracen-7-yl)-9,9''-diphenyl-9H,9'H,9''H-3,3':6',3''-tercarbazole;PM6(PBDB-T-2F);TB-P3Cz;PBDB-T-F;PBDChemicalbookB-T-F,PM6;9'-(2,12-di-tert-butyl-5,9-dioxa-13b-boranaphtho[3,2,1-de]anthracen-7-yl)-9,9''Chemicalbook-diphenyl-9H,9'H,9''H-3,3':6',3''-tercarbazole;PCE14;P141-2F

CAS号：1802013-83-7

分子式：(C68H76F2O2S8)n

PBDB-T-F, PM6、CAS号：1802013-83-7

结构式；

描述：

背景分子对接方法通常用于预测配体与蛋白质的结合模式和能量。对于的复杂几何形状和结合能估计，计算部分电荷的适当方法关重要。AutoDockTools软件是为广泛使用的对接程序AutoDock 4之一准备输入文件的界面，它利用Gasteiger部分电荷计算方法计算蛋白质和配体电荷。然而，已经表明，使用量子化学方法可以实现更的部分电荷计算，从而实现更的对接。对于对接计算，量子化学部分电荷计算作为常规，目前仅用于配体。MOPAC2009新开发的Mozyme函数允许通过量子力学半经验方法快速计算蛋白质的部分电荷。因此，在目前的研究中，可以研究半经验量子力学部分电荷计算对对接精度的影响。结果使用Gasteiger和PM6部分电荷计算方法，在一组53个蛋白质-配体复合物上研究了使用原始AutoDock评分函数的AutoDock 4对接精度。这使我们能够利用AutoDock 4软件比较部分电荷计算方法对对接精度的影响。结果表明，当使用半经验PM6方法计算配体和蛋白质的部分电荷时，关于复杂几何形状的对接精度（当一阶对接结果复合体的RMSD在实验确定的X射线结构的2°范围内时，对接结果定义为准确）显著提高。研究过程中分析的53个络合物中，使用PM6部分电荷计算了42个络合物的几何形状，而使用Gasteiger电荷仅得到28个的几何形状。结合亲和力估计不受部分电荷计算方法的影响-为了更准确地预测结合亲和力，需要为AutoDock开发新的评分函数。结论的结果表明，在配体和蛋白质上使用量子化学部分电荷计算，使用AutoDock 4进行对接计算的复杂几何体的确定精度大大提高。

纯度：95%

用途：仅用于科研

以上资料来自昊然小编 pk2022.07.19

温馨提示：仅用于科研，不能用于人体实验！

公司介绍：

西安昊然生物目前经营的产品主要有合成磷脂，PEG衍生物，嵌段共聚物，纳米金，磁性纳米颗粒，介孔二氧化硅，

活性荧光染料，荧光量子点，点击化学和大环配体等等。