一 、材料、试剂和仪器
1 材料 基因特异引物,转基因烟草和野生型烟草的基因组DNA,含目的基因得质粒
2 试剂 PCR Kit
3 仪器 PCR仪(PE2400),电泳仪,紫外照相装置
二、 操作程序
1. 在灭菌1.5mL管中25μl灭菌ddH2O,,加入100ng-1μg转基因烟草和野生型烟草的基因组DNA中,沸水浴5-10min。取出立即置于冰上,使基因组DNA变性充分。
2.在一灭菌的0.2mL小离心管中依次加入(总体积为25 ul):
10×buffer 2.5μl
4×dNTPs (每种2.5mM ) 2.0μl
primer I (10pmol/μl) 0.5μl
primer II(10pmol/μl) 0.5μl
Template 19μl
Taq E 0.5μl (2U)
把加样品的EP管稍离心后,置冰上备用,待 PCR仪温度升至94℃时,将管子插入,按Pause键暂停,加入Taq E 0.5μl (2U)[此为热启动Hot start,可以防止非特异性扩增 ]。其上机的循环条件为:94℃变性3min ,55℃退火30sec ,72℃延伸45sec ,共进行30个循环,然后72℃再延伸7min 以补平DNA末端。
3. 1%Agarose gel电泳检测,紫外照相。
三、结果与分析
PCR产物经电泳检测在预计的分子量处出现单一DNA条带,但常常是一条带有主带的弥散带,这在以核基因组DNA做模板是常会出现,可能的原因是:核基因组复杂度高,退火温度低,延伸时间长,引物和模板量大等。解决的方法有:采用热启动(如本实验),减少模板和引物量,提高退火温度甚至在68℃下退火和延伸,降低退火和延伸时间,减少循环次数,改变Mg 2+浓度(1.5-8mmol/L)等。
转基因烟草的PCR检测
其中M: DL2000; (+)含目的基因得质粒为模板,作为阳性对照;(-) 为野生型烟草基因组DNA模板作阴性对照;1-5:为转基因烟草基因组DNA为模板。结果表明3非转基因烟草,而1,2,4,5为阳性转基因烟草。特异引物扩增条带长为750bp。
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