1、流动相含有盐分时，做完实验后一定要进行流路冲洗；
　　首先用水冲洗，打开排液阀用PURG键转换出原有含盐的流动相，然后关闭排液阀打开泵冲洗全部流路45分钟以上，如此更换流动相为水和甲醇混合液冲洗全部流路30分钟（此步骤一般可省去，根据实验而论），zui后更换纯甲醇冲洗全部流路45分钟以上。
2、泵头冲洗；
　　用备件中的针头和针管分别用蒸馏水和纯甲醇冲洗3-5ml。
　　如流动相不含盐，可对机器定期进行简单的冲洗维护，根据实验多少而定。
3、进样器冲洗；
　同样用备件中的针管和冲洗针头对手动进样器的装载状态和进样状态分别进行冲洗3-4ml的蒸馏水，然后再冲洗3-4ml的纯甲醇。
4、C18柱不能进蛋白样品、血样，生物样品。
        要注意柱子的PH值范围，不得注射强酸强碱的样品，特别是碱性样品。
　　长时间不用仪器，应该将柱子取下用堵头封好保存，注意不能用纯水保存柱子，而应该用有机相（如甲醇）保存，因为纯水易长霉。
5、流路堵塞问题
　堵塞导致压力太大，按预柱→混合器中的过滤器→管路过滤器→单向阀检查，并清洗。
清洗方法：
①以丙醇作溶剂冲洗
②放在异丙醇中超声波清洗
③用10%稀硝酸清洗。