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siRNA转染标准操作流程

来源:北京百奥创新科技有限公司   2025年07月16日 11:34  

以下是经过优化的 siRNA转染标准操作流程,整合了关键参数优化与避坑指南,适用于绝大多数哺乳动物细胞系(贴壁/悬浮),分为 实验设计、操作步骤、质控要点三部分:

一、实验设计关键点(转染前必看)

要素

推荐方案

避坑提示

siRNA浓度

终浓度10-50nM(预实验梯度测试)

100nM易致脱靶效应

细胞密度

贴壁细胞:30-50%汇合度
悬浮细胞:2-5×10⁵/mL

过密毒性;过低效率

转染试剂

Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
jetPRIME®(原代/难转细胞)

避免含血清培养基稀释试剂

对照设置

- 阴性对照:Scrambled siRNA
- 阳性对照:GAPDH siRNA
- 空白对照:仅转染试剂

缺一不可!












二、标准操作流程(以24孔板为例)

 Day 0:细胞铺板

1. 消化细胞 用wanquan培养基 调整密度 每孔接种 0.5mL(贴壁细胞数:5-8×10⁴;悬浮细胞数:2×10⁵)  

2. 37℃培养箱放置 16-24h(目标:转染时汇合度≈40%)  

关键细节:  

- siRNA工作液浓度 = 储存浓度×30(例:20μM储存液工作液终浓度≈33nM)  

- 转染试剂用量参考说明书(RNAiMAX通常 试剂:siRNA体积比=1:1)  

 Day 2:换液与检测  

1. 转染后 6h 更换wanquan培养基(高毒性细胞如原代神经元需4h内换液)  

2. 继续培养 24-72h(基因沉默峰值时间需预实验确定)  

 三、质控关键步骤(决定成败!)

 1. 转染效率验证(必做)

- 方案1:转染 FAM标记siRNA → 24h后荧光显微镜观察(效率>80%合格)  

- 方案2:共转染 EGFP质粒 计算绿色细胞占比(成本低但间接)  

 2. 沉默效果检测

 3. 细胞毒性评估

- MTT法:转染后24h检测,存活率应>85%  

- 形态观察:悬浮细胞聚团、贴壁细胞空泡化提示毒性过强  

 四、高频问题解决方案

问题

原因

优化方案

效率低

siRNA降解/试剂失效

新解冻siRNA;更换转染试剂批次

细胞死亡率高

复合物局部浓度过高

转染前混匀培养基;悬浮细胞用旋转培养法

沉默效果不稳定

基因半衰期长

延长检测至72h;转染两次(间隔24h

脱靶效应

siRNA种子区匹配非靶基因

更换siRNA序列;使用化学修饰siRNA(如Stealth™

五、特殊细胞优化方案

1. 原代细胞:  

   - 转染试剂:选 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

   - 方案:转染前饥饿处理2h(无血清培养基)复合物孵育时间缩短至5min  

2. 悬浮细胞:  

   - 试剂:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

   - 步骤:离心收集细胞 重悬于复合物 → 24孔板每孔接种500μL(密度5×10⁵/mL)  

3. 难转细胞(如神经元):  

   - 专用试剂:NeuroFect™(佐剂提高穿透性)  

   - 转染后不换液 直接补等体积wanquan培养基  

六、试剂耗材推荐表

类型

推荐产品

适用场景

通用转染试剂

Lipofectamine™ RNAiMAX

293T/HeLa等常见细胞

难转细胞试剂

jetPRIME®

原代/干细胞/悬浮细胞

阳性对照siRNA

Silencer™ GAPDH siRNA

体系验证

阴性对照

AllStars Neg. siRNA

排除非特异效应

> 数据标准:合格实验需满足——转染效率>80% + 沉默效率>70% + 细胞存活>85%

避雷总结:  

1. 勿用含抗生素或血清的培养基稀释复合物(灭活试剂)  

2. 转染后换液时间宁早勿晚(超8h毒性飙升)  

3. 冻存siRNA避免反复冻融>3次(分装储存-80℃)  

按照此流程操作,可稳定获得可重复的基因沉默数据!

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