以下是针对 Coriell Institute(科里尔研究所)的人类基因组DNA标准品的推荐,结合其特色产品和不同研究需求进行分类整理:
一、 Coriell 核心产品推荐
(1) 正常健康对照DNA
产品名称:NA系列标准品(如NA12878、NA19240等)
全基因组测序(WGS)、外显子组测序(WES)的基准对照。
实验室间数据可比性验证(如GATK最佳实践中的标准样本)。
来自健康供体的淋巴母细胞系(LCLs),经EB病毒永生化。
提供高纯度、高完整性的DNA(浓度50-100 ng/μL)。
广泛用于NGS测序技术验证(如NIST基因组参考材料)。
(2) 疾病特异性DNA
产品系列:Coriell Biorepository
提供详细的临床表型和基因型数据(突变位点、遗传模式)。
部分样本含家系配对(患者+正常亲属),适合遗传分析。
遗传病样本:如囊性纤维化(CFTR基因突变)、亨廷顿病(HTT重复扩展)、脊髓性肌weisuo(SMA)等。
肿瘤相关样本:乳腺癌(BRCA1/2突变)、林奇综合征(错配修复基因突变)等。
神经退行性疾病:阿尔茨海默病(APP/PSEN1突变)、帕金森病(LRRK2突变)等。
(3) NIST认证参考材料
产品名称:NIST Reference Materials(如GM12878)
与NIST合作开发的quanwei标准品(如NIST SRM 2372)。
提供已知SNP、Indel、结构变异等位点的基准数据。
适用于临床诊断实验室的合规性验证(CLIA/CAP认证)。
二、按研究领域推荐
(1) 遗传病研究
推荐产品:
HD100:亨廷顿病(CAG重复扩增)患者DNA。
CFTR系列:囊性纤维化相关突变(如ΔF508纯合/杂合)。
用途:基因分型(PCR、Sanger测序)、携带者筛查方法开发。
(2) 肿瘤基因组学
推荐产品:
BRCA1/2突变样本:如AG06840(BRCA1 c.68_69delAG)、AG07095(BRCA2 c.5946delT)。
肿瘤-正常配对样本:部分细胞系提供癌组织与正常组织的配对DNA。
用途:体细胞突变检测、液体活检技术验证。
(3) 群体遗传学与多样性
推荐产品:
HapMap项目样本:如NA10851(欧洲裔)、NA18507(东亚裔)。
1000 Genomes样本:涵盖全球多个人群的基因组DNA。
用途:群体频率分析、祖先信息标记(AIM)研究。
三、特色产品
(1) 定制化混合DNA
产品名称:Custom DNA Mixes
按需混合不同突变型/野生型DNA(如EGFR T790M突变比例梯度)。
模拟肿瘤异质性或嵌合体样本。
用途:检测灵敏度/特异性评估(如ddPCR的LoD验证)。
(2) FFPE模拟DNA
产品名称:FFPE-like DNA Standards
通过化学处理模拟FFPE样本的DNA片段化与损伤。
提供不同片段大小(100-1000 bp)和降解程度的选择。
用途:肿瘤存档样本分析流程的优化。
(3) 无细胞DNA(cfDNA)标准品
产品名称:Cell-Free DNA Reference Materials
含已知低频突变(如1% VAF的KRAS G12D)。
模拟液体活检中的肿瘤源性DNA。
用途:NGS建库技术、液体活检panel的性能验证。
四、购买渠道
Coriell标准品代理——天津益元利康生物科技有限公司,提供NA12878等产品,欢迎咨询选购。
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