使用磷酸化抗体时,需要注意以下事项以确保实验结果的准确性和可靠性:
样本处理:
加入抑制剂:在裂解缓冲液(lysis buffer)中必须加入蛋白酶抑制剂和适量的磷酸酶抑制剂,以抑制组织或细胞裂解过程中释放的内源性蛋白磷酸酶,防止磷酸化蛋白去磷酸化,从而维持蛋白质的磷酸化状态。
确保裂解:建议使用裂解液裂解结合超声处理,确保细胞充分裂解并剪切染色质DNA。超声处理时应保持低温,避免蛋白降解。
新鲜样本:使用新鲜制备的样本,避免反复冻融,以减少磷酸基团的降解。
抗体孵育:
低温孵育:一抗孵育最好在4°C下进行,并过夜孵育,以确保抗体与目的蛋白充分结合。低温有助于维持抗体与抗原的物理吸附,防止高温下抗原脱落。
稀释液选择:根据产品说明书推荐的稀释液稀释抗体,通常建议使用含5%牛血清白蛋白(BSA)的TBST稀释液,而非含脱脂牛奶的TBST,因为脱脂牛奶中可能含有磷酸化蛋白,影响实验结果。
洗涤条件:
洗涤液选择:推荐使用TBST作为洗涤液,相对于PBST,TBST能提供更强的信号。
洗涤次数和时间:洗涤次数和时间需要优化,以避免信号减弱或背景增加。通常建议一抗和二抗孵育后,用TBST洗膜3次,每次5分钟。
封闭条件:
封闭剂选择:虽然网络上流传磷酸化抗体不适于用牛奶封闭的说法,但使用实验级脱脂牛奶进行室温封闭1小时是有效的,且有助于降低非特异性结合。
封闭时间:避免膜封闭时间过长,以免掩盖抗原表位,阻止抗体结合。
对照设置:
阳性对照:设置合适的阳性对照,以确认抗体检测到的特异性信号。
总蛋白和内参对照:除了检测磷酸化蛋白外,还应检测该蛋白的总表达量,以及使用普通内参作为体系对照,保证上样量一致。
实验环境:
低温环境:在整个实验过程中,除超声处理外,应保持低温环境,以防止磷酸化蛋白在室温下被蛋白磷酸酶降解。
结果分析:
分子量比对:在压片后,根据marker比对条带的分子量,确认检测到的条带是否正确。
曝光时间:优化曝光或压片时间,以避免背景过深或条带过浅。
抗体质量:
选择高质量抗体:确保使用的磷酸化抗体质量可靠,并严格按照抗体说明书进行操作。
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