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凝胶色谱仪的工作原理是基于体积排阻色谱法。样品通过凝胶柱时，按分子的流体力学体积不同进行分离，大分子先流出，小分子后流出。色谱固定相是多孔性凝胶，只有直径小于孔径的组分可以进入凝胶孔道。大组分不能进入凝胶孔洞而被排阻，只能沿着凝胶粒子之间的空隙通过，因而被洗提出来。小组分可进入大部分凝胶孔洞，在色谱柱中滞留时间长，会更慢被洗提出来。溶剂分子因体积小，可进入所有凝胶孔洞，因而是从色谱柱中洗提出。
凝胶色谱仪性能指标：
分离度：分离度是衡量其性能的重要指标之一。它决定了高分子聚合物在柱子中的分离效果。因此，在选择时，需要关注仪器的分离度是否满足自己的实验需求。
检测范围：具有不同的检测范围，包括分子量大小、分子量分布等。根据自己的实验需求，选择具有合适检测范围的仪器是非常重要的。
灵敏度与准确性：仪器的灵敏度和准确性直接影响到实验结果的可靠性。因此，在选择时，需要关注仪器的检测灵敏度以及数据的准确性。
凝胶色谱仪的应用实例：
工艺流程分析：通过分析不同工艺流程的分子量分布。
聚合反应监测：在聚合反应过程中不断取样，通过监测来确定聚合条件对产物分子量分布的影响。
高分子降解研究：研究高分子在加工过程中的降解情况，可以细致地观察不同条件下试样柱条的中心和表面的分子量及其分布的差别。
老化机理研究：不仅可以检验老化过程中分子量的变化，而且还可以为老化机理的研究提供数据。
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