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蛋白Marker被称为蛋白质质量标定剂，是一种由已知分子质量的蛋白质混合物构成的，类似于"尺寸"的工具，用于指示蛋白质条带的大小。下面让我们一起来看看非预染蛋白Marker和预染蛋白Marker的区别吧！
非预染蛋白Marker：
是几种已知分子量并纯化好的蛋白质预混液，方便不同大小的蛋白比较。非预染的Marker使用上不如预染Marker好用，因为电泳过程中看不到，电泳结束后经过蛋白染色后才能起指示作用，无法在实验过程中起预示参照作用，属于“后知后觉”型的。但是由于蛋白没有附带染料分子或者是标记分子，所示大小正好是蛋白原本的大小，所以比较准确，可以精确判断蛋白大小。
预染蛋白Marker：
预染蛋白Marker的出现方便了我们的实验，这种蛋白分子量标准可以帮助我们在电泳时、电泳后，以及转膜后监测电泳情况和估计迁移率——比如，已知垂直电泳最佳分辨区域大约在胶的2/3处，如果使用预染Marker就可以预测目标蛋白进入最佳分辨区时停止电泳以得到最佳分辨效果；如果观察到Marker电泳异常也可以及时终止电泳；另外在Western Blot转膜以后可以直接观察蛋白转膜是否**，还可以在膜上标记蛋白分子量，所以吸引了许多实验室人员购买预染蛋白标准。
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