微生物电化学系统（MFCs）在废水处理中实现资源回收与能源生成的方式主要通过以下几个步骤：

1. 微生物的代谢过程：MFCs的核心是利用微生物的代谢能力。在有机物质的氧化过程中，微生物会产生电子，从而将化学能转化成电能。具体来说，微生物将有机物质（如废水中的污染物）氧化成碳酸二氢钠，同时释放出H+和电子（e-）。

2. 电能的生成：在微生物电化学反应池内，这些电子通过产生的电势源加以迁移，形成电流，从而产生电能。这个过程实现了从废水中提取能源的目标。

3. 废水的处理：在产生电能的同时，废水中的有机物质被微生物降解，转化为二氧化碳和水，从而实现了废水的处理。这种处理方式无需添加额外的化学物质，因此是一种环保且可持续的方法。

4. 资源回收：在某些情况下，MFCs还可以用于回收废水中的有价值的物质。例如，某些微生物可以在降解有机物质的同时，吸收并富集废水中的金属离子。通过收集并处理这些微生物，可以实现废水中金属资源的回收。

因此，微生物电化学系统通过微生物的代谢活动，不仅能够有效处理废水，减少环境污染，还能将废水中的化学能转化为电能，实现能源的生成和资源的回收。这种技术具有高效率、清洁、廉价和持久性等优点，在学术界和工业界都受到了广泛的关注。