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凝胶电泳仍然是核酸分离和分析的既定方法。然而，许多使用预制凝胶和标准化试剂的自动化系统现在非常流行。这种方法在有大量样品或需要高通量分析的情况下特别有用。此外，还开发了安捷伦生物分析仪等系统，无需制备电泳凝胶。它们采用在包含互连微储器的小型盒单元上构建的微流体电路。将样品涂在一个区域，并在计算机控制的电泳下驱动通过微通道。这些通道通向储液器，例如允许与其他试剂（例如染料）一起孵育的时间。因此，电泳分离以微米级形式进行。小样本量减少了样本和试剂的消耗，并且由计算机控制的装置允许在很短的时间内捕获数据。
此外，专用分光光度计（例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系统）可以在有限的样品量下快速提供核酸浓度。替代分析方法，包括基于高效液相色谱的方法，已经越来越受欢迎，尤其是 DNA 突变分析。传统上用于蛋白质分析的质谱方法，例如基质辅助激光解吸/电离 (MALDI-TOF)，由于其速度快且可靠性不断提高，也越来越多地用于核酸分析。小样本量最大限度地减少了样本和试剂的消耗，并且由计算机控制的装置允许在很短的时间内捕获数据。此外，专用分光光度计（例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系统）可以在有限的样品量下快速提供核酸浓度。
替代分析方法，包括基于高效液相色谱的方法，已经越来越受欢迎，尤其是 DNA 突变分析。传统上用于蛋白质分析的质谱方法，例如基质辅助激光解吸/电离 (MALDI-TOF)，由于其速度快且可靠性不断提高，也越来越多地用于核酸分析。小样本量最大限度地减少了样本和试剂的消耗，并且由计算机控制的装置允许在很短的时间内捕获数据。此外，专用分光光度计（例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系统）可以在有限的样品量下快速提供核酸浓度。替代分析方法，包括基于高效液相色谱的方法，已经越来越受欢迎，尤其是 DNA 突变分析。传统上用于蛋白质分析的质谱方法，例如基质辅助激光解吸/电离 (MALDI-TOF)，由于其速度快且可靠性不断提高，也越来越多地用于核酸分析。允许在很短的时间内捕获数据。此外，专用分光光度计（例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系统）可以在有限的样品量下快速提供核酸浓度。
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单细胞DNA分析
单细胞 DNA 分析也是近年来许多研究的焦点。荧光激活细胞分选（FACS）、激光捕获显微切割（LCM）和微流体分析等技术极大地提高了这些细胞的分析能力。最近已经采用了许多商业方法，一个例子是 10x Genomics 开发的工艺。这使得一种有趣且新颖的自动化过程成为可能，称为 10x Chromium，可以使用 Illumina HiSeq 系统通过测序来制备、条形码化和分析来自数千个细胞的核酸，以进行单细胞基因表达谱和表征（参见第 1.8.6 节）。诸如此类的新流程提供了有效的方法来对健康和患病状态下的细胞和组织进行有效的进一步分析。
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