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立体显微镜可以用于动物学、植物学、昆虫学、组织学、矿物学、考古学、地质学和皮肤病学等的研究，也可以在纺织工业中原料及棉毛织物的检验，电子工业中作晶体管点焊、检查等操作工具，各种材料的裂缝构成，气孔形状腐蚀情况等表面现象的检查，以及在制造小型精密零件时作机床工具的装置、工作过程的观察、精密零件的检查以及装配工具。
立体显微镜的结构包括以下部分：
目镜：上面标明的数字表示目镜的放大倍数。
镜筒：使光线通过。
细准焦螺旋：转动镜筒升降的幅度小。逆时针转动，镜筒上降；反之，则下降。
粗准焦螺旋：转动镜筒升降的幅度大。逆时针转动，镜筒上降；反之，则下降。
转换器：用来转换物镜。
物镜：上面的数字表示放大倍数。
镜臂：把握部件。
载物台：用来放玻片标本。
通光孔：使光线通过。
压片夹：压住玻片标本。
遮光器：上面有大小不等的圆孔，叫光圈，用来调节光线的强弱。
镜柱：起支撑作用。
反光镜：光强时使用平面镜，光弱时使用凹面镜。
镜座：用来稳定镜身。
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