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一般而言，使用第一代均质腔的设备价格较低，但均质性能不如第二代。使用第二代均质腔的设备，对乳剂的均质效果优良，但处理高浓度、高粘度物料时，较第一代产品更易阻塞，且价格相对较高。所以最终的选择应当根据产品需求和整体性价比来进行确定。
最高均质压力
一般情况下，均质压力越高越好。首先，均质压力越高，均质后的物料粒径将越小越均匀。这就使设备的效率更高，可以通过更少的循环次数达到期望的效果；其次，均质压力越高，可以处理的物料种类越多。例如，某些液体乳剂只需要在20000psi就可以均质到100nm以下，而某些含有较高密度固体颗粒的混悬液，则至少要26,000psi以上的压力下才能处理到纳米级。
但同时需要注意的是均质压力越高，发热量则越大，高温会影响物料的均质效果。所以，一般在没有降温措施的情况下，30000psi是超高压匀质的最高压力。
发展方向
随着我国制造技术的不断发展，已经有很多国产均质机应用在食品、化工等诸多行业。但是，自1986年中国生产第一批药用脂肪乳以来，医药行业使用的超高压匀质机几乎全部来源于进口。其中，最主要的原因就是国产高压均质机的核心部件高压均质腔无法达到行业所需的技术要求。
2010年美国食品与药物管理局（FDA）发布公告，在全美召回11批丁酸氯维地平注射用乳剂。召回原因为产品中可能含有惰性金属颗粒物质。如果这些颗粒发生聚集形成更大的颗粒，理论上将导致毛细血管血流减少，进而引发某些组织的机械性损伤，以及引起急性或慢性炎症反应。某些组织血供减少还可能引起脑、肾、肝脏、心脏、肺等器官缺血或功能不全。因此，在医药行业，不推荐使用第一代碰撞型均质设备。业界常见的碰撞型均质设备早期产品和绝大多数国产机型，这些机型已不适合进行注射用乳剂的大规模生产。
今后，国产高压均质机需要不断提高核心部件高压均质腔的制造技工艺，才可以在医药、半导体、微电子等高精尖领域得到更加广泛的应用。
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