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磁力搅拌器利用了磁场和漩涡的原理，将沉入搅拌子的待搅拌液体之容器放于磁力搅拌器的底座上，当磁力搅拌器通电，底座附近产生一个旋转的磁场带动搅拌子成圆周循环运动，进而容器液体内形成一个漩涡，从而达到搅拌液体的目的。
磁力搅拌器是一种利用磁性物质同极相斥的特性，通过不断变换基座的两端的极性来推动磁性搅拌子转动，再依靠磁性搅拌子的转动带动样本旋转，使样本达到均匀混合的一种仪器。
实验中不但具有搅拌的作用还具有加热的作用。磁力搅拌器能使反应物混合受热均匀，反应。在密闭容器中加热样品都需要对其进行防止瀑沸处理，可以加入沸石也可以使用磁力搅拌器，适用于粘稠度不是很大的液体。磁力搅拌器缺点是能量转化效率低，只适合小体积液体搅拌。尽管台式磁力搅拌器和磁力棒已经得到广泛应用，但目前只局限于研发、小规模的水平。但缺点是对于一些粘稠液或是有大量固体参加或生成的反应，磁力搅拌器无法顺利使用，这时就应选用机械搅拌器作为搅拌动力。
磁力搅拌器原理：通过磁场同级相排斥异级相吸引的原理，利用磁场的转动来带动磁子的转动。也就是利用磁传动进行工作。磁传动是磁力耦合的一种应用。电机或减速机轴与外磁环相联，搅拌轴与内磁环相联。由于磁力的作用，如外磁旋转，内磁跟着旋转，从而带动搅拌轴旋转。
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