如果生物试验中只涉及微生物样品，可以使用基本类型的生物安全柜；
如果生物试验中涉及了微生物样品和微量化学试剂（非腐蚀性），使用装备外排管道的安全柜是必要的。因为HEPA过滤器并不能有效过滤清除化学气体，如果不能外排，将对实验室内工作人员和环境造成威胁；
如果生物试验中涉及了细胞毒素类药物，例如各类癌症治疗药物，使用的细胞毒素安全柜。
生物安全柜是否通过或单位之认证
生物安全柜之排气HEPA过滤器装设位置（侧面或上方）
生物安全柜的高度（含角架之高度）
欲安装之实验室楼层的天花板高度
排气HEPA过滤器是否要求加装排气管
生物安全柜的风车马达是单一或两只；马达转速是否可变
排气HEPA过滤器之厚度
选定品牌型号后要考虑实验室的环境如：
欲安装生物安全柜之实验室空间是否足够
实验室空调冷气量是否足够
实验室HEPA过滤器装设位置
实验室设计是否适合作生物安全柜的熏蒸消毒