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一、应用原理：
(1)通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点，对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速，准确。微生物物种鉴定包括细菌16srDNA鉴定和真菌26S/28SrDNA鉴定、真菌ITS鉴定。
(2)通过大量实验优化的通用引物适用于99%以上的微生物，鉴定成功率在95%以上。常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征；理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。
(3)BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。该系统已获美国FDA认可，已逐步应用于食品和饮品企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微生物、生物治理、化妆品、临床等领域的微生物鉴定试验中。
二、鉴定领域：API鉴定系统涵盖15个鉴定系列，约有1000种生化反应，已可鉴定超过600种的细菌。鉴定过程中，可根据细菌所属类群选择适当的生理生化鉴定系列，通过软件将待测细菌与数据库参比，得出鉴定结果。可应用API50CH系列、API20E系列、APIStaph系列对乳酸杆菌(Lactobacillussp.)和相关细菌、芽孢杆菌(Bacillussp.)、葡萄球菌属(Staphylococcussp.)、微球菌属(Micrococcussp.)和库克菌属(Locuriasp.)进行鉴定。
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