1、使用之前需检查电源插座是否通电，然后检查设备电源线是否有破皮裸露金属线，当一切无误方可连接电源，并根据实验要求在触摸屏上设定好转速、时间、温度等参数。
2、放入试验器皿，要注意放置要对称，并保持设备运转的平衡，同时固定夹紧，检查样品是否密封好，是否有泄漏。
3、打开侧边总电源开关，开启电源，设置恒温温度(加热或者制冷)。
4、开启控制面板上的振荡开关，设定转速，设备缓慢启动，转速盘跳动，设定触摸屏振荡速度，点击开始，启动至所需的振荡频率。
5、使用完毕后，应当暂定设备运转，把转速和控温旋值调节归零，关闭侧边电源总开关，拔下设备电源插座，断开实验室电源。
6、工作结束后应将摇床内部水分排干，有残留的情况下选择对应的清洗剂清洗干净，检测设备是否移位，是否有破损碰撞，检查完毕，开启摇床紫外杀菌灯，进行灭菌消毒。对于摇床的消毒，以下几点同样需要注意：
1)在补充水时把水加热一下，达到培养箱的温度，先用75%酒精擦拭内壁，通风10分钟，紫外线照射30分钟即可。
2)甲醛熏蒸，然后开始排残，起码要一个星期才可以让甲醛散尽，要不细胞长不好的。有的摇床能加热内壁到90度，也有的带有紫外线功能，应每周用酒精擦洗内部一次。
3)一般情况下可用75%的酒精擦拭内壁，然后用甲醛高锰酸钾熏蒸一个晚上，然后通风一整天。
4)把培养箱里的板层拿出来高压一下，箱壁用75%酒精擦一遍，换用诗乐氏擦一遍，再紫外照一夜，效果很好。
5)把平皿高压灭菌后，在无菌操作台内加入适量的灭菌双蒸水或者生理盐水，再加少量新洁尔灭，浓度没关系，细胞养的都可以。