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显微镜数码成像系统具有显微摄像功能，把观察到的显微效果保存下来，形成图文文件，可给相关部门互相传阅；光学显微镜只能通过目镜观察，不能进行显微摄像。
随着科学技术的飞速发展，数码相机成像技术的应用越来越广泛。数码相机和显微镜的相结合又是一次经典的应用，我们在显微镜的基础上，利用数码相机现有的拍摄技术，就可以拍摄出清晰度高、质感好、饱和度强的数码显微照片，凭借多年的显微生产技术，使显微镜和数码相机达到最佳的组合效果。
显微镜数码成像系统一般由载物台、聚光照明系统、物镜，目镜和调焦机构组成：
1、载物台用于承放被观察的物体.显微镜最好安装移动尺或机械载物台。否则直接用手移动，观看标本时会不精确。移动尺实惠些，价格低廉，机械载物台高配些，精确度更高，使用寿命更长。
2、聚光照明系统由灯源和聚光镜构成，聚光镜的功能是使更多的光能集中到被观察的部位.照明灯的光谱特性必须与显微镜的接收器的工作波段相适应。
3、物镜位于被观察物体附近，是实现第一级放大的镜头.在物镜转换器上同时装着几个不同放大倍率的物镜，转动转换器就可让不同倍率的物镜进入工作光路，物镜的放大倍率通常为4～100倍.物镜是显微镜中对成象质量优劣起决定性作用的光学元件.常用的有能对两种颜色的光线校正色差的消色差物镜；质量更高的还有能对三种色光校正色差的复消色差物镜。
4、目镜是位于人眼附近实现第二级放大的镜头，镜放大倍率通常为5～20倍.按照所能看到的视场大小，目镜可分为视场较小的普通目镜，和视场较大的大视场目镜(或称广角目镜)两类。
5、光学显微镜只是光学元件和精密机械元件的组合，它以人眼作为接收器来观察放大的像。
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