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每个四级杆质量分析器有三种工作方式：离子全通过、扫描和离子选择监测。全离子通过是指四级杆不施加直流电压，这样就不过滤离子，所有带电离子全部通过；扫描是指在给定的质荷比范围内，依次采集每个质量数的信号；而选择离子监测模式，只是采集的某个或某几个质荷比的离子信号。
如果要用三重四级杆液质联用仪测试样品，需要提前准备什么呢？
1、选择合适的电离方式
常用的电离方式是大气压电离源(API)，包括电喷雾(ESI)、大气压化学电离源(APCI)。
1.1大气压电喷雾离子源(ESI源)
原理：待测物经液相分离，通过毛细管进入电离源，被离子源的高压电场电离，同时在脱溶剂气和温度的共同作用下雾化，最终形成雾状的带电液滴，随着溶剂不断蒸发，液滴的体积不断变小，电荷在液滴中不断富集，最终在富集到一定程度时，发生“库伦爆炸”，把液滴炸碎，在多次爆炸后，待测物最终被离子化。
适用范围：适合于离子型和极性分析物，灵敏度高，能给出分子量的信息，是目前常用的离子源；化合物无需具有挥发性；是分析热不稳定化合物的方法；能生成一系列多电荷离子，特别适用于蛋白、多肽类生物大分子；流速控制在0.5mL/min内。
1.2大气压化学电离源(APCI源)
原理：是常压下的气态化学电离过程。待测物通过毛细管喷雾来雾化，同时在高温和脱溶剂气的共同作用下快速蒸发溶剂，然后电晕针尖端高压放电，使经过电晕针的待测物发生电离。
适用范围：适合于非极性至弱极性样品，小分子样品以及抗菌素和碱性药物等，且具有一定的挥发性；在相对较高的流速下灵敏度更高。
2、正负离子化模式的选择
正离子模式：适合于碱性化合物，可用甲酸或乙酸对样品进行酸化。样品中含有仲氨或叔氨时可优先考虑使用正离子模式。
负离子模式：适合于酸性化合物，可用氨水对样品进行碱化。样品中含有较多的强伏电性基团，如含氯、含溴和多个羟基时可尝试使用负离子模式。
3、流动相的选择
常用的流动相为甲醇、乙腈、水和它们不同比例的混合物及一些挥发性的缓冲盐，如甲酸铵、乙酸铵等，浓度小于10mmol/L(过高会抑制离子源的信号和堵塞喷雾针及污染仪器);还可以加入易挥发酸碱如甲酸、乙酸和氨水调节PH，浓度小于1%。禁止使用不挥发性的磷酸盐、硼酸盐等(在离子源会沉淀并堵塞毛细管等)，禁止使用会抑制离子化过程的表面活性剂(表面活性剂产生的加合物和离子簇会干扰质谱数据，因此不能使用洗涤剂清洗玻璃器皿等容器)、清洁剂和离子对试剂等，禁止使用盐酸、硫酸等无机酸。
有机试剂必须为色谱级及以上，水用娃哈哈的纯净水。
送样前一定要摸好LC条件，能够基本分离。在液相上摸好的条件，注意尤其是流动相的组成转化成合适的LC-MS条件。
4、样品前处理注意事项
由于液质的流速较小(ESI一般为0.2mL/min)，所以配制样品的溶剂极性强度不能太大，尽量小于起始比例，否则，会出现保留时间偏移等问题。
样品必须过0.22μm滤膜过滤，不得有颗粒物。
样品的溶剂必须是色谱纯，最好和流动相比例一致。
样品中不允许含有金属离子、表面活性剂(不用洗洁精洗瓶子)、磷酸盐、硼酸盐等不挥发盐。
样品pH在5-7范围内，严禁含有无机或有机强酸强碱。
质谱是灵敏度很高的仪器，进样浓度一定不能太高，1-2μg/mL左右就行，太高的浓度对仪器来说容易造成残留，而且定量不准确。
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