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赛默飞液质联用仪主要应用于药物代谢及药物动力学研究、临床药理学研究、天然药物开发研究、新生儿筛选、蛋白与肽类的鉴定、残留分析、毒物分析、环保、食品、自来水、卫生防疫等行业。液质联用仪的灵敏度高，通量性能好——优异的高流量性能、降低的离子抑制效应、自清洁离子源探针设计和可靠的接口设计，加速了分析速度；使用更简便。
液质联用仪主要用途：
该仪器适用于常量，微量，痕量的药物及其代谢物的精确质量测定，结构确证，及多肽，蛋白质，核苷酸，多糖等生物大分子聚合物的序列分析。相对于一般的低分辨率LC-MS，该仪器具有进样量更小(nl级)，灵敏度更高(fmol级)质量范围更大(13000Da)，分辨率更高(>5000FWHM)，且可提供更多结构信息等特点。
赛默飞液质联用仪分类有多种：
1、按分析目的可分：实验室液质联用仪和工业液质联用仪。
2、按离子化方式可分：快原子轰击电离液质联用仪、基质辅助激光解吸电离液质联用仪、电喷雾电离液质联用仪和大气压化学电离液质联用仪等。
3、按质量分析器的工作状态可分：静态液质联用仪和动态液质联用仪。
4、按分析对象的状态可分：原子液质联用仪和分子液质联用仪。
5、按用途可分：生物液质联用仪、制药液质联用仪、化工液质联用仪、食品液质联用仪、医用液质联用仪、氨基酸液质联用仪、核酸液质联用仪、RNA液质联用仪、DNA液质联用仪、细胞液质联用仪、菌体液质联用仪、抗生素液质联用仪和维生素液质联用仪等。
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