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二手PCR仪是一种核酸检测和定量分析的新方法，可以作为传统实时定量PCR的替代方法，以实现一致定量及稀有等位基因的检测。数字PCR的工作原理在于将DNA或cDNA样品分割为许多单独、平行的PCR反应，部分这些反应包含了靶标分子(阳性)，而其他不包含(阴性)。单个分子可以被扩增一百万倍或更多。在扩增期间，TaqMan化学试剂及染料标记探针可用于检测特定序列的靶标。当不存在任何靶标序列时，没有信号累积。PCR分析后，阴性反应片段用于生成样品中靶标分子的一致计数，而无需标准品或内标。
纳流芯片的使用提供了便捷和直观的机制来同时平行运行上千个PCR反应。每个孔都加入了样品、扩增混合物和TaqMan测定试剂的混合物，然后进行单独分析以检测存在(阳性)或不存在(阴性)终点信号。考虑到孔可能接收到多个靶标序列分子，使用泊松模型应用了一个校正因子。
一个合理的二手PCR仪实验室，要时刻注意污染的监测，考虑有无污染是什么原因造成的污染，以便采取措施来防止和消除污染。对于PCR仪的对照实验一般有以下几种：
1.重复性试验。
2.选择不同区域的引物进行PCR扩增。
3.阳性对照
在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照，它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。阳性对照要选择扩增度中等、重复性好，经各种鉴定是该产物的标本，如以重组质粒为阳性对照，其含量宜低不宜高(100个拷贝以下)。但阳性对照尤其是重组质粒及高浓度阳性标本，其对检测或扩增样品污染的可能性很大。因而当某一PCR试剂经自己使用稳定，检验人员心中有数时，在以后的实验中可免设阳性对照。
4.阴性对照
每次PCR实验务必做阴性对照包括：
①标本对照
被检的标本是血清就用鉴定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照；
②试剂对照
在二手PCR仪试剂中不加模板DNA或RNA，进行PCR扩增，以监测试剂是否污染。
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