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制备型高效液相色谱仪通常都被认为和大容量色谱柱和高流速有关联的。然而并不是以设备的大小和系统消耗的流动相的多少来决定制备高效液相色谱，而是依据分离目的来决定。分析液相的目的是给一种组份进行定量和定性。制备液相的目的是对产品的单体进行提取和纯化。与传统的纯化方法(如蒸馏、萃取)比较，制备液相是一种更有效的分离方法，因此被广泛应用在样品和产品的提取和纯化上。
制备液相色谱是使用制备色谱柱从混合物中提取目标化合物的一种分离纯化技术。与其他的色谱分离方法，如薄层色谱法相比，现代制备液相色谱法具有柱效高、分离速度快等特点，是制备纯化天然产物和化学合成产物的很好手段。
制备液相色谱主要用于以下领域：
1.天然药物化学、中药化学。这是国内目前*泛的使用方法，为了弄清楚植物中的微量有效成分，开放手工色谱柱早已不够用了，几乎每个搞天然药化的实验室都至少有一台液相，土豪实验室人手一台液相。
2.蛋白纯化。相对于前者，蛋白纯化的起步要稍微晚一点，但是发展很迅速。同时，由于外国仪器厂家在这个领域的优势不算太大，目前国内也在这个领域加快发展，抢占地盘。
3.药物杂质纯化。由于合成工艺并不能做到100%的产率，往往伴有副产品，如何获得微量的杂质并确定结构和含量，这就得靠液相色谱。
4.手性化合物的制备。这个主要是有机合成和方法学的在用。
总之，目前有机化学领域里，开放手工柱层析依然是常用的分离手段，也是每个有机狗必会的技能之一，其在未来很长一段时间里将仍然扮演重要的角色。制备液相已经在天然药化领域大面积使用，在将来，随着科研的需要和价格的下降，将会逐渐进入千家万户，最终跟旋蒸一样普及。
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