第一步:整理排列好基因登入号,NCBI 检索 nucleotide
第二步:调整展示界面 Display Settings
第三步:选择文件发送内容 Send
第四步:合适的打开方式 DNAstar 软件
下面就给你们演示下:
第一步:每个基因都有它的 Accession number(基因登入号,好比ID一样),这个你们已 经拿到手了吧,首先登入 NCBI 网站ncbi.nlm.nih.gov/,在 All Databases 处下拉, 选择 nucleotide,将基因的 Accession number 都排列在一起,用空格隔开,不要有回车符(怎么快速排列就不多说了,excel 就能实现),例如:NM_181571 NM_012319 NM_016651 NM_007678 NM_004642 NM_145918 NM_024504 NM_014847 NM_004196 NM_002295:
填好后 Search,然后会出现这样一个界面:
第二步:点击上面的 Display Settings 下拉标记,在 Format 选项中选择 FASTA,在 Sort by 选项中默认选择 Default order(界面展示顺序会和你输入的 Accession number 一致):
点击 Apply,就会出现下一个界面:
第三步:点击右上角的 Send 下拉标记,选中 Complete Record 和 File,然后在下面 Format 中选择 FASTA,Sort by 不变(默认),最后点击 Create File 保存数据:
第四步:安装 DNAstar 软件(经常用的序列分析软件,和 Office 办公软件类似,有多款 用途的工具),打开其中的 Editseq 工具,将保存的文件 sequence .fasta 拖进来,这时会弹出 一个界面:
点击 Just Open,就可以直接打开所有下载的基因序列;
如果希望一个一个打开,则点击 OK 先保存基因序列(自动以基因的 Accession number 命名),再选择性打开。
这样就大功告成啦。可是获得了这么多序列可以做什么呢,这个就看你的目的了,分析酶切位点、设计引物、比对序列、构建多表达克隆、设计敲减靶点等等都可以啊!
免责声明
- 凡本网注明“来源:化工仪器网”的所有作品,均为浙江兴旺宝明通网络有限公司-化工仪器网合法拥有版权或有权使用的作品,未经本网授权不得转载、摘编或利用其它方式使用上述作品。已经本网授权使用作品的,应在授权范围内使用,并注明“来源:化工仪器网”。违反上述声明者,本网将追究其相关法律责任。
- 本网转载并注明自其他来源(非化工仪器网)的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品第一来源,并自负版权等法律责任。
- 如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起一周内与本网联系,否则视为放弃相关权利。