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决定尼康显微镜性能的主要因素是显微镜的分辨率，也叫分辨本领或解像力。但是放大率、清晰度等物理量与尼康显微镜的分辨本领有着密切关系。
尼康显微镜是复杂的共轴光学系统。这个系统由光源、孔径光栏、聚光镜和物镜等主要成像要素所构成。目镜只不过是把物像直接放大并投影到屏幕(包括人类视网膜)上的光学部件而已.光源可能是非相干光源如日光、灯光，也可能是相干光源如点光源。
尼康显微镜成像光路中的关键性成像部件是物镜。从光源到物镜前透镜之间的无数个平面，在物镜的后方均有其相对应的共扼平面。但是根据阿贝理论，显微镜里的物平面O与之相对应的共扼平面即像平面O‘和光源I.平面与之相对应的共扼I,‘平面，是成像系统中重要的两对平面。
在显微镜中孔径光栏所限定的入射光束的张角范围内，经过聚光镜直接变成照射标本的照明光源。孔径光栏平面上的光在物镜后焦面或在其附近成像。首先孔径光栏限定成像光束所必需的入射角.这就意味着显微镜下观察物体的适宜的亮度由此决定。其次来自标本的立体结构的不同平面上的成像光线也由此来决定。总之尼康显微镜中的物像的适度反衬度和物像轮廓的清晰度由此来决定。
影响尼康显微镜图像清晰度可以设法校正一种像差是像散。和透射电镜中一样，扫描电镜镜筒的下部也装有一个消像散器。应该认真调节消像器才能保证得到好的图像。如果像散量过大，消像散器的校正场已不足补偿其缺陷，就必须尽快清洗电镜的光路区，常用尼康显微镜型号景深有多大尤其是本透镜和末光阑部分。
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