真空离心浓缩仪工作原理就是采用离心机、真空和加热相结合的方法，在真空状态下离心样品，并通过超低温的冷阱捕捉溶剂，从而将溶剂快速蒸发达到浓缩或干燥样品的目的。真空离心浓缩仪浓缩干燥样品的原理即是通过制造真空环境来降低溶剂沸点、使得溶剂变得容易蒸发，所以，真空泵的选择是第1位的，选择合适的真空泵对实验效率、样品活性、经费都是一个很大的影响。利用真空泵在浓缩仪内形成真空，仪器内气压降低，从而使样品的溶剂沸点降低，溶剂能够在低温下沸腾蒸发；另外能够在仪器腔体内增加一定的热量，从而提高蒸发速率，但是不会对样品的温度产生影响，样品自身温度不会升高；样品在适宜的离心转速下会产生少量的离心力，这个离心力防止了由于样品爆沸而产生的损失，同时也避免了由于加热和离心引起的离心管内产生大量泡沫的现象。离心浓缩后的样品可方便地用于各种定性和定量分析。
 

　　在后期进行生物样本的检测时，例如使用电泳、气象色谱、高效液相色谱、质谱等方法，对于样本的浓度需求较高的实验中，都可以采用真空离心浓缩的方法获得高浓度的样本用于上样。而真空离心浓缩特别适合较敏感的生物样本，例如蛋白质、核酸等物质。因此，真空离心浓缩的主要目的是获得高浓度的样品而不会产生交叉污染、样品丢失、样品变性、样品活性降低或氧化等问题。