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化验室磁力搅拌器如今得到了广泛应用，但只局限于、小规模的水平，人们往往对磁力搅拌器产生错觉，认为磁力搅拌器的力度弱、功率小，不能用于大体积，以及死角、在线清洗（CIP）和在线灭菌（SIP）等，然而，这种观点早已经在现实应用中被推翻。目前，磁力搅拌器应用的种类也更多。从结构来看，一般磁力搅拌器由带阴轴承的转头；阳轴承、罐底焊接板、马达组成。马达驱动头里有几块永磁铁（不是环状），转头里对应的位置也有相同数量的永磁铁，性恰好相互吸引，当安装好以后，马达驱动头和转头里的永磁铁相互之间磁力耦合，马达驱动头运转，磁力带动转头运转，两者被罐底板*隔开，没有机械传动轴贯穿罐体。
转头的设计、转头与轴承的衔接、转头与轴承之间的间隙直接关系到CIP/SIP的效果，一般转头越开放越好。转头的材料，是316L不锈钢，内包永磁铁，轴承材料常用的是碳化硅陶瓷，*惰性，适合pH1-14，热膨胀小，在有水润滑的情况下，可以耐受高达5 000-6 000 rpm的转速不磨损，由于工作状态下的磁力搅拌器，是*浸在溶液下，润滑槽的存在可使溶液通过，从而使整个摩擦界面始终被水膜覆盖，在旋转时，摩擦力非常小，不会出现可以检测到的颗粒，对终产品不会构成威胁。
同机械式搅拌器相比，化验室磁力搅拌器的优势非常明显：
1.底部搅拌器：可搅拌低液位体积，特别适合高附加值无菌产品；
2.无机械密封：无交叉污染及泄漏润滑油的风险；
3.无需挡流板：搅拌更高效，在线清洁更有效；
4.只需要一个喷淋球，高效的CIP和SIP，易于验证；
5.整体购置、维护成本低；
6.易于维护。
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