ZooSCAN浮游动物图像扫描分析系统主要用于对液体中的浮游动物样品进行计数、大小测量、种类鉴定以及生物量测定。
ZooSCAN系统是由ZooSCAN、ZooProcess和EcoTaxa等共同组成的,ZooSCAN是硬件部分,主要进行浮游动物样品扫描,形成数字图像。ZooProcess和EcoTaxa是软件部分,分别以标准化的程序处理原始图像、对不同个体的形态参数进行自动测量和对图像中的浮游动物进行自动分类和计数。
ZooSCAN工作流程
1)扫描空白背景;2)扫描样品,获得原始图片和元数据信息;3)使用ZooProcess软件,标准化原始图片,提取并测量图片中不同个体的形态参数;4) 通过对形态学参数的提取与分析,可进一步获得样品的粒径组成、生物学体积等信息;5)通过EcoTaxa上面已建立的图像培训数据库,针对已扫描的样品图像进行浮游动物的自动识别,获得不同类群浮游动物的数量。
具体操作流程:
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