博思公司的农博士育种家软件(NBSbreeding)一直在开发完善更实用更有价值的软件功能,服务众多软件用户。继自主成功开发BLUP育种值(breeding value)线性混合模型分析方法后,前段时间又进一步推出了REML方差组分估计功能,刚刚过去的70周年国庆,博思公司技术人员一直在工作岗位加班加点,不负众望,( BLUP AB群育种)(GCA)功能开发成功。
农博士育种家软件(NBSbreeding)不断完善自身功能,我们写文章建议植物育种领域要重视育种值应用,用育种值提升一般配合力分析水平,是考虑,植物育种在数据分析领域需要向动物育种借鉴成熟的数学分析方法。作为一款专业的植物育种软件,我们也会把BLUP跟一般配合力(GCA)结合的线性混合模型分析技术开发出来给软件用户使用。我们会推荐建议,但我们一定提供给用户多样选择。我们就是为育种用户服务的。
配合力的计算如果按照配合力公式,真是小学生都可以完成的计算,过于简单了。所以一直猜测,种业大公司不会这样简单的使用配合力,这不,一种复杂的BLUP 配合力分析模型就来了。
本功能开发,参考了美国明尼苏达大学 RexBernardo教授1996年前后发表的BLUP线性混合模型玉米育种应用系列文章,也参考了王健康老师的《应用数量遗传》第二版教材,在此一并致谢。BLUP AB群育种,这个功能命名,主要是明确该BLUP分析功能,是服务于AB群(SS-NSS)育种模式使用的,比如采用SS-NSS思路模式进行的玉米育种,同时该功能*可以应用于类似模式育种的其他作物领域,并不于玉米育种。
功能使用操作简单,选择试验数据,对试验材料相关亲本AB群,就可以进行BLUP线性混合模型分析了。
Rex Bernardo教授采用的模型:
y = Xβ+ Z0c+ Z1g1 + Z2g2 + Zd + e
王健康老师采用的模型
y = Xβ+ Ug1+ Wg2 + Zs + e
农博士育种家软件(NBSbreeding)采用的模型
y =μ+ Xβ+ Ua + Wb + Zs + e
μ:试验数据均值
β:年度+地点的合并固定效应
a:A群一般配合力向量
b:B群一般配合力向量
s:测配组合A×B特殊配合力向量
e:剩余误差向量
X、U、W、Z为相应关联矩阵。
我们根据植物育种特点,结合植物育种数据特点,改造扩展了数学模型,更适合AB群模式育种使用。
BLUP AB群育种使用建议:
在测配组合结果分析时使用,或者配合力试验直接用该功能分析。
给育种者带来的帮助有:
1、计算出试验中亲本材料的一般配合力效应值。据此可以清楚看出亲本的育种价值。
2、计算出测配组合的特殊配合力效应值。对筛选组合有指导价值。
3、利用已测试组合来推断未测试组合的各种效应值,有希望发现更好的未测配材料组合,对减少育种成本,降低测配工作任务量有积极意义。
NBSbreeding育种家软件中BLUP线性混合模型有3种应用可供用户选用:
分别是,
BLUP育种值
REML方差组分估计
BLUP AB群育种
BLUP育种值是基于育种值(breeding value)的BLUP线性混合模型分析方法,而BLUP AB群育种是基于一般配合力(GCA)。关于这两种分析方法的区别和联系,请参照博思公司发布的相关技术资料。
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