育种值（breeding value）在数量遗传学中是占有重要位置的，其在动物育种实践中已被广泛采用，发掘育种值在植物育种中的价值，对植物育种有重要意义。

（一）育种值定义

表现型值 = 基因型值 + 环境效应 + 随机误差

P = G + E + e

G = M + A

表现型值：对表现型的测量值称为该个体的表现型值。以P表示。

基因型值：由个体的基因型所决定的数值称为该个体的基因型值。以G表示。

基因的平均效应：群体内接受了某个基因的所有个体的平均基因型值距群体平均的离差称为该基因的平均效应。

育种值

理论定义：一个个体的育种值，就是它所携带的基因的平均效应的总和。

如果将图中的群体内每一个个体的育种值求累加和，结果=0.

按照育种值的理论定义，一个个体的育种值是跟所在群体有关的，对个体育种值的计算度量离不开所在群体，否则没有意义。也就是说，无法用理论定义来比较两个群体间的育种值，比如，选择前群体和选择后群体。

但是育种值又是跟加性效应对应，这样就好理解为什么数量遗传学给出了育种值的“实际定义”。

实际定义：如果一个个体与来自群体内的许多个体随机交配，则该个体的育种值为其子代均值与群体平均离差的两倍。

实际育种中，通常不清楚控制性状的基因型，群体内的基因频率、基因型频率也是未知，因此理论育种值是不能够直接度量的，能够知道的只是包含育种值在内的各种遗传效应和环境效应共同作用得到的表型值，因此只能利用统计分析方法，通过表型值和个体间的亲缘关系来对育种值进行估计，这就是估计育种值（EBV）。基因型值的加性效应就是育种值。

（二）理论定义与实际定义辨析

1、育种值的理论定义定位于一个群体内部，一个群体内，不同个体间由于基因差异存在不同的育种值，但是一个群体内，所有个体的育种值总和=0.

2、育种值的实际定义立足于子代群体和亲代群体间的均值离差。

3、如果考虑选择育种中的选择响应，在只考虑加性效应，不考虑上位性等其他效应的前提下，估计育种值是选择响应的2倍。选择育种，本质上，就是依据选择前群体和选择后群体间，群体均值、基因加性效应的变化在进行育种选择。

4、常规育种或者杂交育种选育自交系，依据基因的加性效应选择，就是依据育种值在进行选择，因为只有加性效应可以稳定遗传给子代；一个育种材料内在基因加性效应的改良提升，就是育种值的积累，外在就是群体均值的改变，这也是差值选择育种法的含义。

5、BLUP计算植物育种的育种值，一定意义上可以认为是从育种值理论定义出发计算一个群体内不同个体的育种值，尽管其没有采用基因频率，只要模型设置合理，符合群体效应实际情况。因为其分析模型来自数量遗传学的基本模型，并且符合一个群体内所有个体育种值合计=0.

6、BLUP计算植物育种的育种值，比采用群体间均值差异的方式更加合理、数据更准确，因为群体内个体间亲缘关系，以及群体的环境影响，都被纳入了模型，因此计算得到的育种值更接近真实的育种值。

简单的说，就是选择育种和BLUP育种值方法都是利用育种值在进行育种，一个从实际定义出发一个从理论定义出发，一个算的粗糙一些，一个算的更准确一些。

对植物育种来说，只要选择，就可以用育种值。

对杂交育种来说，选自交系，除去早期配合力测定，其余时候用育种值。后期配组合用配合力。

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