Rubicon PicoPLEX 全基因组扩增用于单细胞无创产前检测

Rubicon PicoPLEX

英文名：Rubicon PicoPLEX WGA Kit

中文名：Rubicon单细胞全基因组扩增试剂盒

☆ 单细胞或6pg基因组DNA起始的全基因组DNA扩增试剂盒。

☆ 单个反应管、3小时，3步反应的简单操作流程（手动操作时间只需要15分钟）。

☆ 适合拷贝数变异分析（CNV）、染色体异倍性（aneuploidy）分析。

PicoPLEX WGA Kit采用技术，设计优化用于从单细胞中扩增全基因组DNA。起始样本量低至单细胞或6pg基因组DNA。便捷的单管操作流程降低污染节省时间。结果稳定性、重复性好。

应用推荐：PGS/PGD，单细胞NIPT，循环肿瘤细胞分析

Rubicon PicoPLEX用于NIPT的文献

文献范围：2014年以后发表的文献

应用概述：PicoPLEX单细胞扩增所得文库在下游单细胞的STR、CNV、SNP等遗传变异检测表现良好，适用于单细胞产前无创检测。

1. 

文献：Short Tandem Repeat analysis after Whole Genome Amplification of single B-lymphoblastoid cells.（B淋巴母细胞系单细胞全基因组扩增后的微卫星分析）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大学药物生物技术实验室),et al.

Scientific Reportsvolume 8, Article number: 1255 (2018)

遗传变异检测：短串联重复序列，英文Short Tandem Repeat，简称STR。又称微卫星（Microsalite），简单重复序列（英语：Simple Sequence Repeats，SSRs）。

意义：使用单细胞全基因组扩增（WGA）试剂，以用于下游的单细胞微卫星分析。可用于基于单细胞检测的无创产前检测。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX虽然没有检测到所有微卫星标记，但仍适用于临床单细胞的遗传学鉴别。

2.

文献：STR profiling and Copy Number Variation analysis on single, preserved cells using current Whole Genome Amplification methods.(使用现行全基因组扩增方法对单个保存细胞进行STR和染色体拷贝数变异分析）

Ann-Sophie Vander Plaetsen(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大学药物生物技术实验室),et al.

Scientific Reportsvolume 7, Article number: 17189 (2017)

遗传变异检测

STR

CNV：英文 Copy Number Variation，染色体拷贝数变异

意义：单细胞无创产前检测等液体活检因为细胞的稀有和脆弱，需要更的单细胞分析技术。PicoPLEX等单细胞全基因组扩增试剂盒可以对微量DNA进行无偏向的WGA扩增，以用于下游STR和CNV分析。

方法：细胞用Streck Cell-Free DNA BCT 采血管保存，使用PicoPLEX等WGA试剂盒进行单细胞全基因组扩增后进行STR与CNV分析。

Rubicon PicoPLEX作用：在几种WGA试剂盒中，PicoPLEX表现良好，对于STR和CNV均适用。

3.

文献：Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.（四种全基因组扩增方法用于单细胞拷贝数变异检测的性能表现）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大学药物生物技术实验室),et al.

遗传变异检测：CNV

意义：单细胞全基因组扩增技术可用于胚胎植入前遗传诊断，单细胞无创产前检测和循环肿瘤细胞的液体活检。即PGD、NIPT和CTC。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX试剂扩增单细胞后，适合通过低深度全基因组大规模平行测序（MPS，又名NGS）进行CNV分析。

4.

文献：Evidence for feasibility of fetal trophoblastic cell‐based noninvasive prenatal testing.(胎儿滋养细胞用于单细胞无创产前检测可行性的证据）

Amy M. Breman（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine贝勒医学院 分子与人类遗传学系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 12 September 2016.

遗传变异检测：染色体和亚染色体变异

意义：通过孕早期（10-16周期）母体血液获得胎儿细胞，单细胞全基因组扩增后，进行基因分型。

方法

扩增：WGA技术

分析：array CGH 或 NGS

Rubicon PicoPLEX作用：用于单细胞全基因组扩增。

5.

文献：Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic

aberrations in single cells.(三种用于单细胞基因组结构异常检测的全基因组扩增方法比较）

Elizabeth Normand（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine贝勒医学院 分子与人类遗传学系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 02 July 2016

Keywords: Whole genome amplification, array CGH, genotyping, non-invasive prenatal

diagnosis, fetal cells

关键词：全基因组扩增，微阵列比较基因组杂交，基因分型，无创产前诊断，胎儿细胞

遗传变异检测：染色体拷贝数异常

意义：比较了三种商业全基因组扩增（WGA）试剂盒从单细胞中获得高质量DNA的能力。结果显示WGA试剂所得DNA文库适合用于单细胞分子分型和拷贝数分析。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX相比其他品牌试剂盒对于非固定细胞的SNP检测较好。

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