1, SNP序列查询
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
2, 搜索目的SNP位点:(rs114234235为例)
3,搜索结果
4, 点击查看明细
5, SNP明细信息:
6, 获取SNP上下游序列:
>gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos=201|totalLen=401|taxid=9606|snpclass=1|alleles='A/C'|mol=Genomic|build=151
GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA
CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC
TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC
TCCCCGCGCC GCATTAGGGG
M
GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG
CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT
TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA
TGCTCAAGGA GGAGAGGATC
7, 在SNP对应基因中进行比对
rs114234235位于PRKG1基因的启动子区域;
http://www.umibio。。cn/Luciferase
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