产品推荐:气相|液相|光谱|质谱|电化学|元素分析|水分测定仪|样品前处理|试验机|培养箱


化工仪器网>技术中心>操作使用>正文

欢迎联系我

有什么可以帮您? 在线咨询

Random priming

来源:上海锐谷生物科技有限公司   2010年12月18日 14:31  

DNA聚合酶要进行DNA聚合反应时一定要有引子 (primer),因为它只能以引子所提供的3’-OH为起始点进行延伸 (extension) 的工作,而不能就地重新合成新的DNA (de novo synthesis)。 一般实验常以人工合成的寡核苷酸为引子进行DNA聚合反应,这时固然可以根据已知序列设计核酸引子,但也可以采用逢机引子(random primers)。 所谓逢机引子即其序列为逢机序列,不经特别设计,目前应用zui广者是以自动化机器所合成的、六到八个核苷酸长的寡核苷酸混合物;反应进行中若有任何一条逢机引子结合到模版DNA,即可引导DNA聚合反应的进行。 以random priming方法进行核酸标定,是以逢机引子引导Klenow fragment(large fragment of E. coli DNA polymerase I) 进行DNA聚合反应,并在反应过程中添加 [α-32P]dNTP或DIG-11-dUTP等标定物质。 而为了避免random priming也发生于载体部份的DNA,不要直接以质体DNA为模版进行标定反应,而应预先将目标DNA自载体切除出來。

 
仪器用具:微量离心机;沸水浴及冰浴
 
药品试剂:
模版DNA (pBlueGus 的BamHI-HindIII DNA 片段,将由助教提供)
0.2 M EDTA, pH 8.0
4 M LiCl
Random priming kit (Roche):
Hexanucleotide mix (random primer)
dNTP mixture (1 mM dATP, 1 mM dCTP, 1 mM dGTP, 0.65 mM dTTP, 0.35
mM DIG-11-dUTP, pH 7.5)
Klenow enzyme (2 U/μL)
酒精
70%酒精
TE (10 mM Tris-Cl, pH 8.0; 1 mM EDTA)
 
方法步骤:
◆ 以下反应条件与步骤主要参照random priming kit 制造厂商所提供的产品说明书。
1) 取100 ng 模版DNA,加入适量去离子水,把体积补足为15 μL。
2) 于沸水中加热10 min。
◆ 请记得以夹子固定微量离心管的管盖部份,以免离心管在加热过程中盖子爆开、进水!
3) 加热后,迅速把微量离心管移至冰浴中,静置数分钟。
4) 离心数秒后,依序加入下列三种试剂:
2 μL hexanucleotide mix
2 μL dNTP mixture
1 μL Klenow enzyme
5) 以指头轻弹离心管,以便混合均匀。
6) 短暂离心后,置于37℃恒温水槽中作用2 h。
◆ 反应时间至少须要1 h,zui长可反应过夜。
7) 作用完毕的后,加入2 μL 的0.2 M EDTA,以便终止DNA 聚合反应。
8) 加入2.5 μL 4 M LiCl及75 μL纯酒精,混合均匀,置 -20℃过夜。
隔天:
1) 于13,000 rpm,4℃离心15 min。
2) 倒出上清液,加入50 μL 的70%酒精,再离心5 min。
3) 倒出上清液并风干DNA。
4) zui后以50 μL TE 溶解DNA。

免责声明

  • 凡本网注明“来源:化工仪器网”的所有作品,均为浙江兴旺宝明通网络有限公司-化工仪器网合法拥有版权或有权使用的作品,未经本网授权不得转载、摘编或利用其它方式使用上述作品。已经本网授权使用作品的,应在授权范围内使用,并注明“来源:化工仪器网”。违反上述声明者,本网将追究其相关法律责任。
  • 本网转载并注明自其他来源(非化工仪器网)的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品第一来源,并自负版权等法律责任。
  • 如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起一周内与本网联系,否则视为放弃相关权利。
企业未开通此功能
详询客服 : 0571-87858618