当今蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性分析转向定量分析。 定量蛋白质组学是对 细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达进行定量分析,对生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现 与验证具有重要意义[1,2] 。 定量蛋白质组学分为相对定量与定量[3] 。 相对定量即差异比较,通过质谱 大规模、高通量地对两种或多种不同生理、病理条件下的样本进行定量分析,获得蛋白质表达量的差 异,主要方法有稳定同位素标记和非标记两种技术手段[4,5] 。 定量即获得蛋白的具体表达量,利用 质谱监测目标蛋白的专一性肽段(Unique Peptide)获得色谱鄄质谱峰面积,并与已知量的标准肽段(外标 法)或稳定同位素标记的重标肽段(内标法)比较确定具体量,实现定量。 主要质谱方法是对专一 性肽段进行选择反应监测或称多反应监测(Selected / Multiple reaction monitoring, SRM/ MRM) [6] 。
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