Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一种发近红外（NIR）荧光的花青素荧光染料。它的消光系数高，荧光也很亮，并且对pH不敏感，并且由于它的荧光波长（Em：~700nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以Cy5.5常应用于小动物活体体内成像中。 Cy5.5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，纳米粒等，它***常见的使用是标记核酸分子（DNA和RNA）。

NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中***常用的活化基团。它活化Cy5.5分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把Cy5.5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），Cy5.5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和Cy5.5-NHS反应。

Cy5.5-NHS活化酯的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即sulfo-Cy5.5-NHS活化酯。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。

英文名：Cyanine5.5 NHS ester

NHS-Cy5.5 

中文名：花青素CY5.5活性酯

花青素CY5.5琥珀酰亚胺酯

CAS号：2375105-86-3

分子式：C44H46N3BF4O4

分子量：767.66

结构式：

ex/em：680/698 nm （PBS缓冲液）

消光系数(ε)：209000 L?mol?1?cm?1

***产率(Φ)：0.2

外观：深蓝色固体

溶解性：易溶于DMF等有机溶剂

保存条件：避光，干燥，-20oC保存

运输条件：室温

简介：氰基5.5 NHS酯是一种活性染料，用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸（Cy5.5NHS酯的类似物）中的氨基。Cy5.5是一种远红色（和近红外）发射染料，非常适合于背景荧光受到关注的荧光测量。它也适用于体内近红外成像实验。该试剂可替代Cy5.5和DyLight 680的NHS酯。

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