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上海一研生物科技有限公司

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费氏弧菌发光杆菌中“隐秘”基因簇大揭底

阅读:906      发布时间:2017-10-18
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费氏弧菌发光杆菌作为自然界第二大类生物,是天然药物创制的重要来源。然而,大量真菌基因组测序表明,真菌中超过 90% 的次级代谢产物合成基因簇处于沉默状态,极大地限制了新代谢产物的发现及其合成机制研究。中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室研究员尹文兵课题组针对真菌中大量“隐秘”基因簇的问题,长期从事从基因到次级代谢产物的研究,主要方向包括真菌次级代谢产物激活、生物合成及其调控机制研究,近一年来取得了三个具有系统性和原创性的成果。

“这三个成果是天然产物发现及后续改造利用的上游和下游的关系。”尹文兵解释。

*个成果是使用表观遗传策略挖掘真菌天然产物多样性。他们通过对植物内生真菌无花果拟盘多毛孢中的表观遗传调控因子进行定向遗传敲除,发现该菌的次级代谢产物指纹图谱发生了巨大变化,从中分离鉴定得到了 15 个新的聚酮类天然产物,并通过同位素示踪法阐释了产物 Ficiolide A 的合成途径。

“我们通过对遗传转化技术进行改良,大大缩短了真菌转化的周期,该研究为新天然产物的发现提供了的方法。”

在此基础上,科学家们开展了生物合成机制研究,阐明重要生防菌淡紫拟青霉中脂肽类抗生素 leucinostatins 的生物合成途径。

在与中国农业科学研究院蔬菜花卉研究所研究员谢丙炎课题组的合作下,科学家们通过对淡紫拟青霉进行基因组测序并结合比较基因组学分析,预测了脂肽类抗生素 leucinostatins 的合成基因簇。再通过对候选基因的遗传敲除,鉴定了 leucinostatins 的合成基因簇,并且解析了其合成途径。这一工作对防治植物线虫等多种病虫害药物的开发奠定了理论基础。

此后,尹文兵又和北京大学药学院叶敏团队合作,费氏弧菌发光杆菌将真菌糖基转移酶应用于天然产物成药性改善。
T细胞调控相关蛋白抗体    英文缩写:    CRTAM
突触后蛋白CRIPT抗体    英文缩写:    CRIPT
钙粘附蛋白8抗体    英文缩写:    Cadherin 8
6号染色体开放阅读框174抗体    英文缩写:    C6orf174
6号染色体开放阅读框150抗体    英文缩写:    C6orf150
X染色体开放阅读框56抗体    英文缩写:    CXorf56
9号染色体开放阅读框152抗体    英文缩写:    C9orf152
6号染色体开放阅读框58抗体    英文缩写:    C6orf58
接触蛋白相关蛋白4抗体    英文缩写:    CNTNAP4
CD24抗体    英文缩写:    CD24
接触蛋白相关蛋白3抗体    英文缩写:    CNTNAP3 
CD24抗体    英文缩写:    CD24
限局性核因子3抗体    英文缩写:    NLF3
胰羧肽酶A6抗体    英文缩写:    CPA6
费氏弧菌发光杆菌

 

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