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温度加热方式一般分水套式和气套式。水套式适合实验环境不太稳定（如有用电限制或经常停电）的用户选用，气套式特别有利于短期培养以及需要箱门频繁开关取放样的培养。此外，对于使用者来说气套式设计比水套式更简单化（水套式需要对水箱进行加水、清空和清洗，并要经常监控水箱运作的情况，还有潜在的污染隐患）。
可靠的温控系统是培养箱*的重要部分。目前市面上主流的温度传感器有两线制和四线制PT100温度传感器，其中四线制比两线制更为。用户应选用高度的温度传感器并且具备相互独立多重温度控制功能的二氧化碳培养箱，即箱内温度控制、高/低温报警、多重过温保护等。同时，在选择气套式的培养箱时，培养箱内还应装有风扇以保证箱内空气的循环和流通，保证箱内的温度、CO2浓度、相对湿度的专一性。
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