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恒远告诉大家:关于WB实验的常见问题以及解决方案(3)
阅读:2365 发布时间:2012-9-14
上海恒远生物科技有限公司是一家生物技术企业,主要从事免疫学、分子生物学和常规生化试剂的研发、销售。并代理销售Omega、Sigma、R&D、ATCC、HYCLONE等二十多家国外,致力于为广大高校、科研院所和企事业单位提供*的科研试剂和完善的技术服务,满足生物化学、分子生物学、细胞生物学、免疫学等生物科技实验需求。
21、想分离的蛋白是分子量200kd的,SDS-PAGE电泳的分离胶浓度多大合适?积层胶的浓度又该用多少?这么大分子量的蛋白容易作Western Blot吗?
答:200kd的蛋白不好做,分离胶用7%,积层胶 3.5%。
22、如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量?
答:可以浓缩样品,也可以根据你的目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超载30%是不会有问题的。如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的。
23、蛋白变性后可以存放多久?
答:-80℃,一两年没有问题。zui关键两条:不要被蛋白酶水解掉;不要被细菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所测定的蛋白分子量是105KD,按理说分离胶应当采用7.5%,但资料却要求分离胶和浓缩胶均采用11%的配方,不知为何?
答:上述提到的两种凝胶均可以使用,因为105KD的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意条带位置。
25、二抗是生物素化的抗体,三抗是亲和素生物素体系,不知采用这样的方案后,封闭液是否要作调整,能否再用5%的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉会影响亲和素生物素的,是吗?
解答:不能使用脱脂奶粉,因为脱脂奶粉中含生物素,用BSA代替应该好一点.
26、问一般一次上样的蛋白总量是多少,跟目的蛋白的表达量有关系吗?
答:Western Blot一般上样30-100微克不等,结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和孵育时间都有关系,也与显色时间长短有关。开始摸条件时,为了拿到阳性结果,各个步骤都可以量多一点时间长一点,当然背景也就出来了。要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易,抗体不好的话就需要反复地试了,当然有的不适合Western Blot的怎样做也不行。
27、做组织样品的western的时候,怎样处理样品?
答:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28、问大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot时要注意,分离胶选择>7%的;剥胶时要小心;转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上样量?
答:a)可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量;b)用5倍的上样缓冲液来稀释变性
30、蛋白的上样量有没有什么具体的要求?
答:上样量要根据实验的要求来定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 则上样量要均等,如果只是要定性,则没有太大的关系,尽量多上就行了,但是不要超载。
答:200kd的蛋白不好做,分离胶用7%,积层胶 3.5%。
22、如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量?
答:可以浓缩样品,也可以根据你的目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超载30%是不会有问题的。如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的。
23、蛋白变性后可以存放多久?
答:-80℃,一两年没有问题。zui关键两条:不要被蛋白酶水解掉;不要被细菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所测定的蛋白分子量是105KD,按理说分离胶应当采用7.5%,但资料却要求分离胶和浓缩胶均采用11%的配方,不知为何?
答:上述提到的两种凝胶均可以使用,因为105KD的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意条带位置。
25、二抗是生物素化的抗体,三抗是亲和素生物素体系,不知采用这样的方案后,封闭液是否要作调整,能否再用5%的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉会影响亲和素生物素的,是吗?
解答:不能使用脱脂奶粉,因为脱脂奶粉中含生物素,用BSA代替应该好一点.
26、问一般一次上样的蛋白总量是多少,跟目的蛋白的表达量有关系吗?
答:Western Blot一般上样30-100微克不等,结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和孵育时间都有关系,也与显色时间长短有关。开始摸条件时,为了拿到阳性结果,各个步骤都可以量多一点时间长一点,当然背景也就出来了。要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易,抗体不好的话就需要反复地试了,当然有的不适合Western Blot的怎样做也不行。
27、做组织样品的western的时候,怎样处理样品?
答:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28、问大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot时要注意,分离胶选择>7%的;剥胶时要小心;转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上样量?
答:a)可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量;b)用5倍的上样缓冲液来稀释变性
30、蛋白的上样量有没有什么具体的要求?
答:上样量要根据实验的要求来定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 则上样量要均等,如果只是要定性,则没有太大的关系,尽量多上就行了,但是不要超载。
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