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公司动态

大肠杆菌抽取RNA

阅读:1248          发布时间:2010-7-7

之前已分别构筑出GUS 基因的表现质体pQG11,?要?启动子T5promotor 的启动受到?好的调控,应进一步将pQG11 转形至大肠杆菌M15[pREP4]。 M15[pREP4] 可持续表现lac repressor,pQG11 上用以驱动GUS基因表现的T5 promoter 的活性将因而受到抑制,但一旦加入IPTG 就能诱导GUS基因大?表现。 在这一节的实验里,我们将分别自经IPTG 诱导与未经诱导的pQG11/M15[pREP4] 菌体抽取total RNA,以?以?方杂合反应分析GUS mRNA的表现情形。 下面所采用的方法适用于大肠杆菌及其他革?氏阴性菌total RNA的抽取,实验进?时先以lysozyme 分解细胞壁,再以sodium dodecyl sulfate (SDS)?解原生质膜 (Summers, 1970; Ausubel et al., 2005);的后加入适?的氯化钠溶液将SDS、蛋白质及大肠杆菌的染色体DNA 一并沉淀下?,并以离心法移除,存?于上清液的RNA 则以酒?沉淀。 实验过程所使用的RNase 抑制剂为DEPC。
仪器用具:恒温震荡培养箱37℃;冰浴;微?离心机;分光光?计 (Hitachi U-1100 spectrophotometer)
药品试剂:大肠杆菌菌株pQG11/M15[pREP4];LB 培养液;Ampicillin (100 mg/mL);Kanamycin (25 mg/mL);IPTG (1 M);Protoplasting buffer (15 mM Tris-HCl, pH 8.0; 0.45 M sucrose; 8 mM EDTA, stored at 4℃);Lysozyme (50 mg/mL);Gram-negative lysing buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0; 10 mM NaCl; 1 mM sodium citrate; 1.5% SDS);Diethylpyrocarbonate (DEPC);饱和氯化钠溶液 (以40 g氯化钠溶解于100 mL dH2O/DEPC);酒?及70%酒?
方法步骤:
大肠杆菌pQG11/M15[pREP4] 的培养:
1) 将pQG11/M15[pREP4] 接种于2 mL含ampicillin (100 μg/mL) 及kanamycin(25 μg/mL) 的LB培养液,于37℃震荡培养过夜。
2) 隔日早晨,取0.5 mL pQG11/M15[pREP4] 过夜培养液,加入25 mL 含有ampicillin (100 μg/mL) 与kanamycin (25 μg/mL) 的LB 培养液,于37℃震荡培养2 h。
3) 加入25 μL 1 M IPTG,继续放置于37℃震荡培养。
4) 经过4 h 后,取出pQG11/M15[pREP4] 培养液,开始进?RNA 制备工作。
制备RNA:注意!进?以下RNA 制备实验时,除?使用依上述步骤所准备的pQG11/M15[pREP4] 培养液外,请记得向助教?取未经IPTG 诱导的pQG11/M15[pREP4] 培养液当做对照组。
1) 取出4 支1.5 mL 微?离心管,分别标示为I-1, I-2, U-1 与U-2。
2) 取3 mL 经IPTG 诱导的pQG11/M15[pREP4] 培养液平均分置于微?离心管I-1 与I-2。
3) 取3 mL 未经IPTG 诱导的pQG11/M15[pREP4] 培养液平均分置于微?离心管U-1 与U-2。
4) 以8,000 rpm (4℃) 离心5 min,小心倒掉上清液,并以微?移液器尽?吸掉残?的液体。
5) 各加入0.5 mL protoplasting buffer,以微?移液器将大肠杆菌充分悬浮。
6) 再加入1 mL protoplasting buffer 与12 μL 50 mg/mL lysozyme,混合均匀的后,移置于冰浴中作用15 min。
7) 以7,000 rpm 于4℃离心5 min。
8) 小心倒出上清液,并以微?移液器尽?吸掉残?的液体。
9) 各加入75 μL gram-negative lysing buffer 及2 μL DEPC,以微?移液器小心悬浮沉淀于管底的大肠杆菌原生质体,并离心数秒。 在以微?移液器悬浮大肠菌原生质体时,一旦pellet 被充分打散即应停止悬浮动作,以避免大肠菌DNA 断?可能造成的问题。 DEPC 可能是一种致癌物质,使用时请在抽气橱内操作。
10) 将微?离心管放入37℃恒温水槽作用5 min。
11) 作用完毕的后,将离心管移到冰浴中静置5 min。
12) 加入38 μL 饱和氯化钠溶液,以手指头轻弹管壁,充分混合均匀。
13) 静置于冰浴中作用10 min,此时应有白色沉淀出现。
14) 以13,000 rpm 于4℃离心10 min。
15) 将上清液移至新的微?离心管,并加入0.3 mL 酒?。
16) 混合均匀后将离心管放置于 -20℃过夜,以?沉淀RNA。 RNA 在酒?内相当稳定,?须长期保存,可停在这一步。
17) 以14,000 rpm 于4℃离心15 min。
18) 小心倒掉上清液后,加入300 μL 70%酒?。
19) 以14,000 rpm 于4℃离心5 min 的后,小心倒掉上清液。
20) 将微?离心管倒置于桌面上30 min,以?风干RNA。
21) 将RNA溶解于30 μL dH2O/DEPC。
22) RNA定?:取5 μL RNA,加入995 μL dH2O/DEPC稀释的后,以分光光?计测其在260 nm与280 nm的吸光值 (记得使用石英测光管),并计算RNA的浓?与A260/A280的比值。 RNA溶液在260 nm的吸光值为1.0 时,则浓?相当于40 μg/mL,而其A260/A280的比值应为1.7~2.0 (DNA则为1.8 左右)。 这四个RNA 样本将于后续实验中,分别以甲醛洋菜胶体电泳进?分析
 

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