辣椒（Capsicum annuum）是一种重要的经济作物，它在满足人们口腹之欲的同时，还是世界上广为使用的药物。辣椒富含维生素和营养，可以用来生产许多药物、天然染色剂和化妆品。
为了更好的理解辣椒属的进化、驯化和特化，四川农业大学玉米研究所、遵义农科院辣椒研究所、华南农业大学园艺学院、华大基因等机构的研究人员对栽培辣椒及其野生祖先进行了基因组测序。文章于三月三日发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。
研究人员获得了3.48Gb的基因组草图，并对其中79%的基因进行了染色体定位，获得了高密度的遗传图谱。研究显示，反转录转座元件的快速扩增，使辣椒基因组与其它茄科植物的基因组相比发生了扩张。在辣椒基因组中，约81%都是重复性序列。
研究人员比较了栽培辣椒Zunla-1 (C. annuum L.)及其野生祖先 Chiltepin (C. annuum var. glabriusculum)的基因组，发现了人工选择的分子足迹，找到了一系列候选驯化基因。研究指出，串联重复基因的剂量补偿效应可能为辣椒赋予了辣味上的多样性。
这项研究不仅为辣椒基因组和茄科基因组的进化研究提供了关键信息，还有助于人们开展更有效的辣椒育种项目。(此前，另一个研究团队也发布了辣椒的基因组测序成果，详见：Science新闻，辣椒基因组测序完成)