生物通报道：来自中科院北京基因组研究所的研究人员通过对8种真核生物的蛋白和潜在的开放阅读框的基因进行全基因组尺度的计算分析，取得了种属特异性小蛋白的功能和进化研究方面的新进展，相关成果公布在《生物化学与生物物理进展》上。生物通 www.ebiotrade.com
这项研究由北京基因组研究所于军研究员和肖景发副研究员等人完成，获得了国家自然基金和国家重点基础研究发展计划项目（种属特异性小蛋白的功能和进化研究）的支持。
小蛋白（小于个100氨基酸长度的蛋白）在原核和真核生物中广泛存在。但由于计算生物方法和实验技术上存在缺陷，早期针对小蛋白的研究仅仅局限在一些小蛋白家族的功能分析上，并没有跨真核物种的大规模组学分析来揭示小蛋白的功能和进化特征。生物通 www.ebiotrade.com

在这篇文章中，研究人员对这8种真核生物的蛋白和潜在的开放阅读框的基因进行全基因组尺度的计算分析，长度小于100氨基酸的蛋白按照序列保守性划分成三类（分别是普遍存在的小蛋白、只存在于脊椎动物的小蛋白和只存在于哺乳动物的小蛋白），余下的是种属特异性小蛋白。研究发现，这三类保守性的蛋白只占很少一部分，而种属特异性小蛋白占大多数。进一步研究人类小蛋白在各组织中的表达情况发现，大多数人类*的小蛋白也是组织表达特异性的，而那些古老的小蛋白的保守性较强而且在人体各组织中普遍表达。因此研究人员认为，物种在进化过程中，一些真核小蛋白出现并在自然选择压力下富集，行使不同的特异性功能。生物通 www.ebiotrade.com

除此之外，近期于军研究组还通过对人类千人基因组计划数据的比较分析，进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在，使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和进化机制研究获新进展。相关学术论文在《PLoS ONE》杂志发表。生物通 www.ebiotrade.com
内含子是真核基因组的重要和必需组成部分，并且它在mRNA的加工、选择性剪接和核外运输等过程中发挥着且复杂的作用。在基因组进化研究中，尽管内含子并没有像编码区域一样受到足够的重视，但越来越多证据表明内含子和它们的序列受到潜在功能相关的自然选择作用。
这项研究表明在不同人类群体中，小内含子的长度和GC含量都受到某种自然选择（适应性选择或者负选择）的作用而保持在zui适值附近。这些结果为“突变力”模型提供了证据：偏离长度值的小内含子更容易发生插入删除突变。区别于在果蝇中发现的“选择力”模型，揭示了脊椎动物这一分支中小内含子的进化动力学特性，强调了小内含子的潜在的功能重要性，为后续的各物种小内含子功能研究的实验和生物信息研究奠定了理论基础。