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分子生物学和遗传学、计算和存储以及通信领域与稻米

阅读:1002          发布时间:2011-1-6

2008年7月1日随着人们对性饥荒的担忧,IBM和华盛顿大学的研究人员日前推出了一个新项目来研发更强壮的稻米品系,这些品系的稻米产量将会更高,而且营养更加丰富。

  拥有167万亿次浮点处理能力(相当于世界超级计算机前3强的总和)的IBM网格大同盟(World Community Grid)将采用一项新的计划以利用近一百万台个人PC“贡献”出来的空闲处理能力。这一名为“为世界提供高营养稻米”的项目将在原子尺度上对稻米进行研究,然后再将其与农民们历*用过的各种传统的交叉育种技术相结合。
  中国科学院北京基因组研究所副所长于军教授认为:"水稻是中国的主要粮食作物,这项关于营养水稻的联合研究的任何进展都意味着中国将从中受益zui多!"
  这一项目将在不到两年的时间内完成。而如果使用传统计算机系统的话,完成这一工作将需要200年以上。
  设在菲律宾的稻米研究院院长Robert Zeigler表示:“世界正在同时经历三场革命,这三场革命分别发生在分子生物学和遗传学领域、计算和存储领域以及通信领域。计算革命让世界各地的科学家们得以结成一个社区,实时地解决复杂得难以相象的问题。虽然没有有效的解决方案,但在新技术的帮助下,稻米产量仍将会获得新的突破。网格大同盟必须为现在和长久的未来进行投资。”
  网格大同盟将运行一个由华盛顿大学的计算生物学家们创建的三维建模程序,研究构成稻米主体的各种蛋白质的结构。了解这些结构是确定这些蛋白质功能*的前提,并将帮助研究人员确定哪些结构会有助于提高产量、防治害虫、抵抗疾病或提供更多营养。这一项目zui终将提供zui大和zui全面的稻米蛋白质及其相关功能图谱,帮助农学家和农民确定应选择哪些植物进行交叉育种,从而培育出更好的农作物。
  华盛顿大学微生物学系副教授、研究员Ram Samudrala博士表示:“问题在于需要研究30000到60000种不同的蛋白质结构。如果在实验室中使用传统试验方法来确定关键蛋白质的详细结构和功能,将会需要数十年的时间。如果在网格大同盟上运行我们的程序,可以将所需时间从200年缩短到两年之内。”
  “为世界提供高营养稻米”这一项目通过美国自然科学基金获得了200万美元的快速启动资金,zui终可能会帮助稻米生产国更好地适应未来的气候变化。这些国家将可以快速找到进行交叉育种的合适植物,从而开发出对不断变化的气候模式更具抵抗力的“超级杂交稻”。
  另外,在创建三维模型过程中所获得的知识还可轻松应用在其它谷类作物如玉米、小麦和大麦上面,所以这项研究对于美国和其它国家来说也很重要。
  网格大同盟目前达到了一个新的里程碑,其注册计算机数量已经突破了一百万台,从而更加有助于各项科学研究取得进步。每周都有数以千计的人们签约参与网格大同盟,这已经显著推动了多个疾病(如癌症和艾滋病)研究项目的进步。营养稻米项目是使用这一网格的项目,可能会对健康状况产生重大影响。
  IBM公众事业合作部副总裁及IBM基金会总裁Stanley Litow表示:“这一项目zui终可能会帮助世界各地的农民种植更好的作物,并帮助一些人解决饥荒问题。如果有人希望参与这项伟大的事业,他今天就可以向此目标迈出一小步——将自己计算机的空闲时间贡献出来。志愿者可以以个人方式影响到这项研究的进展速度,并会对亟需研究成果的农民和其它人产生重大的影响。”
  任何拥有计算机和互联网接入功能的人都可以参与到这项解决方案之中。如果希望贡献自己空闲不用的计算机时间,个人可以登录www.worldcommunitygrid.org并在计算机上安装一个安全、免费的小软件。当计算机处于空闲状态时,可以请求网格大同盟的服务器提供数据。这些计算机随后就可以执行相关计算并将结果返回到服务器,提示服务器继续执行新的任务。当人们的计算机被使用时,屏幕保护程序会给出提示。
  作为目前zui大的公益性网络,网格大同盟拥有来自200多个国家的超过38万名会员,连接了超过一百万台计算机。正是在志愿者们的帮助下,网格大同盟才取得了这样的成就,因为当每一个人都贡献出自己的计算机时间时,科学家们就可以加快自己的研究速度。例如,AfricanClimate@Home项目刚刚完成了数据采集工作,现在就将开始进行研究分析工作。
  “没有网格大同盟的帮助,项目就不可能这么快地完成。研究结果将帮助我们更好地了解南非陆地表面的变化对气候产生了什么样的影响,并将为其它后续气候研究扫清障碍。”  另外,新泽西癌症研究所在网格大同盟上开展了一个名为“帮助击败癌症”(Help Defeat Cancer)的项目并因此于2007年从美国健康协会(National   Institute of Health)获得了250万美元的研究补助。FightAIDS@Home项目仅在六个月内就完成了本来需要五年才能完成的HIV/AIDS研究。网格大同盟上现在正运行着其它五个项目,还有更多的项目正在等待之中。

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