IFT早在1961年就开始用于人类流感的快速诊断，1984年宾夕法尼亚州暴发禽流感时Skeeles将IFT用于AIV的检测。用于禽流感病毒的诊断常用直接荧光抗体法，即在组织触片上直接染色、以荧光显微镜检查荧光。一种AIV的荧光抗体可用来检测不同亚型的其他病毒。IFT用于禽流感的诊断具有快速、简便和敏感性好的特点，而且检测成本费用相对较低，其敏感度与病毒的分离鉴定相当，有时高于用鸡胚进行的病毒分离。但是需要注意的是如何避免和降低标本中出现的假阳性（即非特异性荧光）问题。

 

    对一株杂交瘤细胞分泌的流感病毒的单克隆抗体进行检测时，发现间接固相免疫荧光技术的敏感性比HI高40～150倍。间接免疫荧光技术也可以用来检测核蛋白（N尸）和基质蛋白（M1）抗原与抗体的反应，其敏感性很高。该反应对抗原制备要求较高，需用非离子型去污剂对纯化的病毒粒进行裂解。

 

    由于单克隆抗体的问世，大大提高了免疫荧光测定的效果。免疫荧光用于禽流感的诊断具有快速（2h之内）、特异和敏感性高的特点，但是其不能鉴别HA和NA亚型，而且需要特殊的设备（荧光显微镜），且工作人员需具有一定的经验，所以在基层检测单位推广应用具有一定的局限性。