Chromium Controller 单细胞测序仪

一、仪器简介：

（1）单细胞测序仪器设备Chromium Controller，是一款小巧的单细胞建库解码系统，可放置在标准实验工作台上。能够在十几分钟内高效地自动化生成大于10万个含有条形码的纳升级分区，从而实现高度并行的样品分液和添加分子标签。
（2）一次处理多达8个样品，每个样本可分析100-10000个细胞。结合Cell Ranger数据分析软件和Loupe Browser可视化软件，轻松实现单细胞水平转录组、免疫分析、基因组拷贝数变异和染色质开放性等研究。品牌10x Genomics，型号GCG-SR-1，产地新加坡，代理商是斑马鱼（北京）科技有限公司。

二、为何选择10X单细胞测序？

（1）细胞异质性是造成生物复杂性的一个关键因素，但往往被群体细胞分析技术——比如RNA测序（RNA-seq）或芯片分析等所掩盖。
（2）单细胞测序技术并非提供平均数据来显示细胞如何工作，而是让研究人员能够更全面地鉴定组织异质性、识别稀有细胞类型，并逐个细胞地解析分子机制。这种高分辨率能带来突破性的成果，4000多篇采用10x Genomics公司技术的文献便是很好的证明。

三、单细胞测序仪工作流程：

单细胞测序流程是从单细胞或细胞核悬液开始的。采用先进的微流体技术生成含有单细胞或细胞核的微滴。接着按照简化的流程来构建文库。测序后采用整合的数据分析流程和可视化软件来处理和分析数据——此软件对新用户来说足够直观，对专家来说又足够强大。

四、技术原理：

Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数，包括基因表达、染色质可接近性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑。这项技术的核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴，而每个微滴都含有一个可识别的条形码，便于下游分析。

五、Next GEM技术：

①每个Chromium解决方案都从高度多样化的凝胶珠（GelBeads）开始，每个凝胶珠都带有的寡核苷酸条形码标签序列，以及便于捕获目标分子的功能化序列。

②在Chromium系统内，将带有条形码标签的凝胶珠与细胞或细胞核、酶以及分液油混合，产生成千上万个单细胞乳液微滴，这些微滴被称为“GEM”（Gel Bead-in-emulsion）。

③每个GEM都作为单独的反应微滴，凝胶珠在其中溶解，捕获每个细胞的目标分子，添加条形码并扩增。

④添加条形码后，来自同一细胞或细胞核的所有片段都共享一种10x 条形码。将成千上万个细胞的带有条形码的产物混合，进行下游反应，从而产生与短读长测序仪兼容的文库。

⑤在测序后，生物信息学工具将利用可识别的条形码序列将测序片段定位到原本的单细胞或细胞核。

六、一个系统可实现多种单细胞应用：

1. 单细胞基因表达：以单细胞分辨率对数百个至数万个细胞进行全面的3’或5’转录组测序，从而鉴定细胞异质性，探索发育和疾病背后的机制，并追踪细胞谱系。

2. 单细胞免疫分析：能够在单细胞基础上对数万个T细胞和B细胞的全长配对受体测序和基因表达谱分析，分析免疫细胞组库，确定B细胞和T细胞的抗原特异性，表征组织微环境，超越传统的流式细胞术。

3. 单细胞表观基因组分析：染色质转座酶可接近性分析（ATAC），实现数万个单细胞核的表观基因组分析，定义细胞类型和细胞状态，收录细胞类型特异性的调控因子，鉴定重要的转录因子，绘制基因调控网络。

4. 单细胞蛋白表达：全面分析细胞类型和表型，验证单细胞RNA-seq的结果，并阐明细胞信号通路，有助于探索分子机制或改变药物发现。

5. 单细胞多组学ATAC + 基因表达解决方案：同时分析数万个细胞的同一细胞内基因表达和开放染色质，关联调控元件和目标基因，表征细胞异质性，发现新的基因调控相互作用，鉴定罕见的细胞类型。

七、技术培训和支持：Xenium、Visium CytAssist、Chromium Connect，Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼（北京）科技有限公司是10x Genomics代理商，负责销售仪器和试剂，具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验，可为用户提供单细胞悬液制备，建库，测序，生信分析等一整套解决方案。在购买仪器后，将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后，客户还将获得支持，包括远程技术支持（Technical Support）、现场应用科学家（FAS）、现场服务工程师（FSE）和生物信息学应用（Applied Bioinformatics）团队，覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。

八、仪器技术参数：

1、功能用途：通过对数千上万个细胞的独立分封，逆转录，添加标签序列，建库，实现对每个细胞的cDNA添加标签并建库。系统兼容单细胞3’表达谱测序，单细胞5’表达谱测序，单细胞VDJ全长测序，单细胞CNV测序和单细胞ATAC测序。

2、系统可以产生不少于50万个独立的液滴反应体系；

3、提供至少300万种序列标签标记每个细胞的转录组；

4、分析细胞数量：每个样本可分析100-10000个细胞；

5、细胞捕获效率：可达65%以上；

6、可同时检测来自同一细胞的 mRNA 和细胞表面蛋白；

7、可靶向检测人泛癌、免疫相关、特征性基因等，每种panel 已验证基因数超过 1000 个；

8、针对单细胞 V(D)J 分析，可获得单个 T 细胞 TCR 的α链和β链的配对序列信息；

9、针对单细胞 V(D)J 分析，可获得单个B细胞 BCR的重链和轻链的配对序列信息；

10、针对单细胞 ATAC 分析，线粒体污染率低于 2%；

11、针对单细胞多组学ATAC+基因表达分析，可同时检测来自同一细胞的mRNA和染色质可及性；

12、通量：一次可处理样本数量不少于8个；

13、提供序列完整单细胞分析软件系统；

14、仪器大小尺寸：20 x 26.3 x 16.4 cm；

15、重量：5.6公斤。

七、斑马鱼（北京）科技有限公司，是10x Genomics公司的授权经销商，负责产品的推广销售和技术支持，为您提供技术参数，报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等，更多信息可和我们联系。