毛细管电泳仪常用检测器有紫外可见吸收检测器、荧光检测器、激光诱导荧光检测、安培检测器、电导检测器和质谱检测器等。其性能如下：
    一、紫外可见吸收检测器：
    1、检测下限：10ˉ6～10ˉ5mol/L
    2、特点：适合有紫外吸收的化合物
    3、是否柱上检测：是
    二、荧光检测器：
    1、检测下限：10ˉ8～10ˉ7mol/L
    2、特点：灵敏度高，样品常需衍生化。
    3、是否柱上检测：是
    三、激光诱导荧光检测：
    1、检测下限：10ˉ12～10ˉ10mol/L
    2、特点：灵敏度非常高，样品常需衍生化。
    3、是否柱上检测：是
    四、安培检测器：
    1、检测下限：10ˉ9～10ˉ8mol/L
    2、特点：灵敏度高，选择性好，需专门装置测电活性物质。
    3、是否柱上检测：否
    五、电导检测器：
    1、检测下限：10ˉ7～10ˉ5mol/L
    2、特点：通用性好，需专门装置和毛细管处理。
    3、是否柱上检测：否
    六、质谱检测器：
    1、检测下限：10ˉ9～10ˉ7mol/L
    2、特点：通用性好，可提供结构信息，接口复杂。
    3、是否柱上检测：否